Evaluation of immune repertoire inference methods from RNA-seq data reply

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F18%3A00106648" target="_blank" >RIV/00216224:14740/18:00106648 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1038/nbt.4296" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/nbt.4296</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1038/nbt.4296" target="_blank" >10.1038/nbt.4296</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Evaluation of immune repertoire inference methods from RNA-seq data reply

Popis výsledku v původním jazyce

Clinical and biological studies are often aimed at discovering a small fraction of T cell receptor (TCR) or immunoglobulin variants shared between samples or groups of samples—for example, when searching for the common clonotypes involved in response to tumor antigens, infectious agent antigens or self antigens1. In this context, even a single false intersection between immune repertoires extracted from different samples may compromise the utility of the results. Among the scientific community, complementarity-determining region 3 (CDR3) with designated V and J gene segments is the accepted identifier that unambiguously defines TCR alfa- or a beta-chain sequence.

Název v anglickém jazyce

Evaluation of immune repertoire inference methods from RNA-seq data reply

Popis výsledku anglicky

Clinical and biological studies are often aimed at discovering a small fraction of T cell receptor (TCR) or immunoglobulin variants shared between samples or groups of samples—for example, when searching for the common clonotypes involved in response to tumor antigens, infectious agent antigens or self antigens1. In this context, even a single false intersection between immune repertoires extracted from different samples may compromise the utility of the results. Among the scientific community, complementarity-determining region 3 (CDR3) with designated V and J gene segments is the accepted identifier that unambiguously defines TCR alfa- or a beta-chain sequence.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

30102 - Immunology

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Nature biotechnology

ISSN

1087-0156

e-ISSN

—

Svazek periodika

36

Číslo periodika v rámci svazku

11

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

1035-1036

Kód UT WoS článku

000450374000011

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85056318843