Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Connection of glycoinformatics databases with Pubchem

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F18%3A00108837" target="_blank" >RIV/00216224:14740/18:00108837 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Connection of glycoinformatics databases with Pubchem

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Nowadays, information about structure of organic molecules and proteins is stored in general databases and described via common data formats. Unfortunately, glycoinformatics databases are isolated and use specialised data formats. For better work with interesting data stored in these databases, it is necessary to link together information from these specialized databases with general-purpose database. Among such specialised databases belong for example GlyConnect and UnicarbKB – databases of glycan structures, which utilise GlycoCT data format [1]. We developed a workflow for translation of GlycoCT format to common molecular formats SMILES, InChI and InChIKey. Based on these standard formats, we established a linkage between GlyConnect, UnicarbKB and PubChem [2] databases. We will present the workflow and information describing a matching between these databases.

  • Název v anglickém jazyce

    Connection of glycoinformatics databases with Pubchem

  • Popis výsledku anglicky

    Nowadays, information about structure of organic molecules and proteins is stored in general databases and described via common data formats. Unfortunately, glycoinformatics databases are isolated and use specialised data formats. For better work with interesting data stored in these databases, it is necessary to link together information from these specialized databases with general-purpose database. Among such specialised databases belong for example GlyConnect and UnicarbKB – databases of glycan structures, which utilise GlycoCT data format [1]. We developed a workflow for translation of GlycoCT format to common molecular formats SMILES, InChI and InChIKey. Based on these standard formats, we established a linkage between GlyConnect, UnicarbKB and PubChem [2] databases. We will present the workflow and information describing a matching between these databases.

Klasifikace

  • Druh

    O - Ostatní výsledky

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LQ1601" target="_blank" >LQ1601: CEITEC 2020</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů