Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Dual redox labeling of DNA as a tool for electrochemical detection of p53 protein-DNA interactions

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F19%3A00108148" target="_blank" >RIV/00216224:14740/19:00108148 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68081707:_____/19:00501012 RIV/61388963:_____/19:00501012 RIV/00216208:11310/19:10394770

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0003267018312959?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0003267018312959?via%3Dihub</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.aca.2018.10.053" target="_blank" >10.1016/j.aca.2018.10.053</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Dual redox labeling of DNA as a tool for electrochemical detection of p53 protein-DNA interactions

  • Popis výsledku v původním jazyce

    We present a novel dual redox labeling approach enabling a facile relative evaluation of protein-DNA interactions based on immunoprecipitation at magnetic beads (MBIP) with subsequent electro-chemical detection. DNA probes labeled with two different electroactive markers, benzofurazane and nitrobenzene, which yield reduction peaks at distinct potentials, were synthesized using primer extension (PEX) reaction. We show that using the labeled DNA probes, specific and non-specific binding of the p53 protein can be distinguished in a simple competition binding experiment, as a strong preference of the p53 protein was observed towards DNA probes bearing a specific p53 binding site (p53CON), which is in agreement with known binding properties of the p53 protein. The p53 binding to the individual DNA probes can be modulated by specific monoclonal antibodies used for the immuno-precipitation. This approach can potentially be applied, after selection of appropriate DNA probes and monoclonal antibodies, for investigations of DNA-binding properties of other proteins and thus represents a versatile tool for studies of any DNA-binding proteins. (c) 2018 Elsevier B.V. All rights reserved.

  • Název v anglickém jazyce

    Dual redox labeling of DNA as a tool for electrochemical detection of p53 protein-DNA interactions

  • Popis výsledku anglicky

    We present a novel dual redox labeling approach enabling a facile relative evaluation of protein-DNA interactions based on immunoprecipitation at magnetic beads (MBIP) with subsequent electro-chemical detection. DNA probes labeled with two different electroactive markers, benzofurazane and nitrobenzene, which yield reduction peaks at distinct potentials, were synthesized using primer extension (PEX) reaction. We show that using the labeled DNA probes, specific and non-specific binding of the p53 protein can be distinguished in a simple competition binding experiment, as a strong preference of the p53 protein was observed towards DNA probes bearing a specific p53 binding site (p53CON), which is in agreement with known binding properties of the p53 protein. The p53 binding to the individual DNA probes can be modulated by specific monoclonal antibodies used for the immuno-precipitation. This approach can potentially be applied, after selection of appropriate DNA probes and monoclonal antibodies, for investigations of DNA-binding properties of other proteins and thus represents a versatile tool for studies of any DNA-binding proteins. (c) 2018 Elsevier B.V. All rights reserved.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10406 - Analytical chemistry

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Analytica Chimica Acta

  • ISSN

    0003-2670

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    1050

  • Číslo periodika v rámci svazku

    MAR

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    123-131

  • Kód UT WoS článku

    000455933400014

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85055755902