Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

PiggyBac transposon tools for recessive screening identify B-cell lymphoma drivers in mice

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F19%3A00113244" target="_blank" >RIV/00216224:14740/19:00113244 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.nature.com/articles/s41467-019-09180-3" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41467-019-09180-3</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-09180-3" target="_blank" >10.1038/s41467-019-09180-3</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    PiggyBac transposon tools for recessive screening identify B-cell lymphoma drivers in mice

  • Popis výsledku v původním jazyce

    B-cell lymphoma (BCL) is the most common hematologic malignancy. While sequencing studies gave insights into BCL genetics, identification of non-mutated cancer genes remains challenging. Here, we describe PiggyBac transposon tools and mouse models for recessive screening and show their application to study clonal B-cell lymphomagenesis. In a genome-wide screen, we discover BCL genes related to diverse molecular processes, including signaling, transcriptional regulation, chromatin regulation, or RNA metabolism. Cross-species analyses show the efficiency of the screen to pinpoint human cancer drivers altered by non-genetic mechanisms, including clinically relevant genes dysregulated epigenetically, transcriptionally, or post-transcriptionally in human BCL. We also describe a CRISPR/Cas9-based in vivo platform for BCL functional genomics, and validate discovered genes, such as Rfx7, a transcription factor, and Phip, a chromatin regulator, which suppress lymphomagenesis in mice. Our study gives comprehensive insights into the molecular landscapes of BCL and underlines the power of genome-scale screening to inform biology.

  • Název v anglickém jazyce

    PiggyBac transposon tools for recessive screening identify B-cell lymphoma drivers in mice

  • Popis výsledku anglicky

    B-cell lymphoma (BCL) is the most common hematologic malignancy. While sequencing studies gave insights into BCL genetics, identification of non-mutated cancer genes remains challenging. Here, we describe PiggyBac transposon tools and mouse models for recessive screening and show their application to study clonal B-cell lymphomagenesis. In a genome-wide screen, we discover BCL genes related to diverse molecular processes, including signaling, transcriptional regulation, chromatin regulation, or RNA metabolism. Cross-species analyses show the efficiency of the screen to pinpoint human cancer drivers altered by non-genetic mechanisms, including clinically relevant genes dysregulated epigenetically, transcriptionally, or post-transcriptionally in human BCL. We also describe a CRISPR/Cas9-based in vivo platform for BCL functional genomics, and validate discovered genes, such as Rfx7, a transcription factor, and Phip, a chromatin regulator, which suppress lymphomagenesis in mice. Our study gives comprehensive insights into the molecular landscapes of BCL and underlines the power of genome-scale screening to inform biology.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature Communications

  • ISSN

    2041-1723

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    10

  • Číslo periodika v rámci svazku

    MAR

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    16

  • Strana od-do

    1-16

  • Kód UT WoS článku

    000462721900014

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85063729846