Rapidly Display Glycan Symbols in 3D Structures: 3D-SNFG in LiteMol

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F19%3A00113368" target="_blank" >RIV/00216224:14740/19:00113368 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.8b00473" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.8b00473</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.8b00473" target="_blank" >10.1021/acs.jproteome.8b00473</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Rapidly Display Glycan Symbols in 3D Structures: 3D-SNFG in LiteMol

Popis výsledku v původním jazyce

The representation of carbohydrates in 3D space using symbols is a powerful visualization method, but such representations are lacking in currently available visualization software. The work presented here allows researchers to display carbohydrate 3D structures as 3D-SNFG symbols using LiteMol from a web browser (e.g., v.litemol.org/?loadFromCS=5T3X). Any PDB ID can be substituted at the end of the URL. Alternatively, the user may enter a PDB ID or upload a structure. LiteMol is available at https://v.litemol.org and automatically depicts any carbohydrate residues as 3D-SNFG symbols. To embed LiteMol in a webpage, visit https://github.com/dsehnal/LiteMol.

Název v anglickém jazyce

Rapidly Display Glycan Symbols in 3D Structures: 3D-SNFG in LiteMol

Popis výsledku anglicky

The representation of carbohydrates in 3D space using symbols is a powerful visualization method, but such representations are lacking in currently available visualization software. The work presented here allows researchers to display carbohydrate 3D structures as 3D-SNFG symbols using LiteMol from a web browser (e.g., v.litemol.org/?loadFromCS=5T3X). Any PDB ID can be substituted at the end of the URL. Alternatively, the user may enter a PDB ID or upload a structure. LiteMol is available at https://v.litemol.org and automatically depicts any carbohydrate residues as 3D-SNFG symbols. To embed LiteMol in a webpage, visit https://github.com/dsehnal/LiteMol.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Proteome Research

ISSN

1535-3893

e-ISSN

—

Svazek periodika

18

Číslo periodika v rámci svazku

2

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

770-774

Kód UT WoS článku

000457947700026

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85053939910