Classification of species to higher taxa based on analysis of DNA barcodes - a bird example

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F13%3APU105320" target="_blank" >RIV/00216305:26220/13:PU105320 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Classification of species to higher taxa based on analysis of DNA barcodes - a bird example

Popis výsledku v původním jazyce

DNA barcoding based on mitochondrial gene analysis is a modern method for species identification. We tested three variations of a novel method for species classifica-tion into families and orders based on the nucleotide density of the mtDNA barcode. We verified the methods on datasets of bird barcode sequences. The reference database of species families was created from South American bird species. North American, European, and Asian birds of the same families but mostly different species were classified effectively nearly 88.13 percent into families and 99.51 percent into orders in best case for the third variation of the method.

Název v anglickém jazyce

Classification of species to higher taxa based on analysis of DNA barcodes - a bird example

Popis výsledku anglicky

DNA barcoding based on mitochondrial gene analysis is a modern method for species identification. We tested three variations of a novel method for species classifica-tion into families and orders based on the nucleotide density of the mtDNA barcode. We verified the methods on datasets of bird barcode sequences. The reference database of species families was created from South American bird species. North American, European, and Asian birds of the same families but mostly different species were classified effectively nearly 88.13 percent into families and 99.51 percent into orders in best case for the third variation of the method.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GAP102%2F11%2F1068" target="_blank" >GAP102/11/1068: Nano-elektro-bio-nástroje pro biochemické a molekulárně-biologické studie eukaryotických buněk (NanoBioTECell)</a><br>

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

The 10th International Workshop on Computational Systems Biology

ISBN

978-952-15-3092-0

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

75-79

Název nakladatele

Neuveden

Místo vydání

Tampere

Místo konání akce

Tampere

Datum konání akce

10. 6. 2013

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—