Visualization of multi-modal volume segmentation

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F14%3APR27806" target="_blank" >RIV/00216305:26220/14:PR27806 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/48277-visualization-of-multi-modal-volume-segmentation" target="_blank" >http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/48277-visualization-of-multi-modal-volume-segmentation</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Visualization of multi-modal volume segmentation

Popis výsledku v původním jazyce

It can visualize single- or multi-modal 2D or 3D images in a selected plane, which can be switched. Modalities are switched by left slider, slices are changed by botom slider. Planes are switched by radiobutton group. It can be used for visualization ofthe segmentation, where the segmentation has to be a binary matrix. For the evaluation purposes, the manual segmentation can be input as the third argument. Both segmentation are depicted with different color (red and blue). In this case, the evaluationcoefficients (Jaccard, Dice, Tanimoto, Accuracy, TPR, FNR, FPR and FNR) are computed and shown in table for particular slice and for the whole volume. This may require RoI definition, which can be input as the fourth argument, otherwise the whole image/volume is considered. These coefficients may be obtained the output of the function.

Název v anglickém jazyce

Visualization of multi-modal volume segmentation

Popis výsledku anglicky

It can visualize single- or multi-modal 2D or 3D images in a selected plane, which can be switched. Modalities are switched by left slider, slices are changed by botom slider. Planes are switched by radiobutton group. It can be used for visualization ofthe segmentation, where the segmentation has to be a binary matrix. For the evaluation purposes, the manual segmentation can be input as the third argument. Both segmentation are depicted with different color (red and blue). In this case, the evaluationcoefficients (Jaccard, Dice, Tanimoto, Accuracy, TPR, FNR, FPR and FNR) are computed and shown in table for particular slice and for the whole volume. This may require RoI definition, which can be input as the fourth argument, otherwise the whole image/volume is considered. These coefficients may be obtained the output of the function.

Druh

R - Software

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GAP102%2F12%2F1104" target="_blank" >GAP102/12/1104: Studium metabolizmu a lokalizace primárního mozkového tumoru MR zobrazovacími technikami</a><br>

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Multi-modal visualization

Technické parametry

Software je určen pro rozšíření knihoven MATLAB. Knihovna je plně kompatibilní s verzí programu MATLAB 8.3 (R2014a). Software je volně stažitelný.

Ekonomické parametry

bez ekonomických parametrů. Software umožňuje vizualizaci segmentace v multi-modálních 3D obrazech a její vyhodnocení. Je možné jej využít pro porovnání výsledku automatického algoritmu s manuální segmentaci pro ověření funkčnosti daného algoritmu. Je vhodný pro rychlejší zjištění důvodu a místa případného selhání automatického algoritmu, čímž umožňuje zrcyhlení jeho vývoje.

IČO vlastníka výsledku

00216305

Název vlastníka

Ústav telekomunikací