Identification of housekeeping genes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 RNA-Seq transcriptome

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F19%3APU133861" target="_blank" >RIV/00216305:26220/19:PU133861 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.medsci.cn/sci/show_paper.asp?id=f4c3a121a852869f" target="_blank" >https://www.medsci.cn/sci/show_paper.asp?id=f4c3a121a852869f</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Identification of housekeeping genes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 RNA-Seq transcriptome

Popis výsledku v původním jazyce

Housekeeping genes are responsible for maintenance of basic cellular function. Their expression level is expected to be constant under normal as well as stress conditions and in all stages of cell cycle. Thus, the housekeeping genes represent the minimal set of genes required to sustain life. In addition, the housekeeping genes are used in many biotechnological applications and genomic studies as reference genes for data normalization. In this study, we focused on identification of housekeeping genes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 genome. We performed bioinformatics analysis of transcriptomic data of this strain obtained by RNA-Seq technology and differential expression analysis of processed data revealed candidate reference genes for Clostridium beijerinckii NRRL B-598.

Název v anglickém jazyce

Identification of housekeeping genes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 RNA-Seq transcriptome

Popis výsledku anglicky

Housekeeping genes are responsible for maintenance of basic cellular function. Their expression level is expected to be constant under normal as well as stress conditions and in all stages of cell cycle. Thus, the housekeeping genes represent the minimal set of genes required to sustain life. In addition, the housekeeping genes are used in many biotechnological applications and genomic studies as reference genes for data normalization. In this study, we focused on identification of housekeeping genes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 genome. We performed bioinformatics analysis of transcriptomic data of this strain obtained by RNA-Seq technology and differential expression analysis of processed data revealed candidate reference genes for Clostridium beijerinckii NRRL B-598.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

<a href="/cs/project/GA17-00551S" target="_blank" >GA17-00551S: Vztah mezi efluxem butanolu a tolerancí k butanolu u klostridií</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Proceedings of the 7th International Conference on Chemical Technology

ISBN

978-80-88307-00-6

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

67-71

Název nakladatele

Czech Society of Industrial Chemistry

Místo vydání

neuveden

Místo konání akce

Mikulov

Datum konání akce

15. 4. 2019

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

000515696600012