Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

OPERON-EXPRESSER: The Innovated Gene Expression-based Algorithm for Operon Structures Inference

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F21%3APU141194" target="_blank" >RIV/00216305:26220/21:PU141194 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.fekt.vut.cz/conf/EEICT/archiv/sborniky/EEICT_2021_sbornik_1.pdf" target="_blank" >https://www.fekt.vut.cz/conf/EEICT/archiv/sborniky/EEICT_2021_sbornik_1.pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    OPERON-EXPRESSER: The Innovated Gene Expression-based Algorithm for Operon Structures Inference

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Current biotechnological research of bacterial genomes has huge potential due to the use of next-generation sequencing (NGS) platforms. NGS era opens paths for analysis of data for sufficient description of microorganisms with ecology and biotechnology potential in the future. Although some tools for inference of specific structures in bacterial genomes exist, their pipelines and methodologies are often based only on searching bacterial genome databases and comparison with model microorganisms. This paper deals with the design of a new algorithm for operon structures inference in bacterial genomes. The algorithm combines searching in bacterial databases and gene expression information processing. The algorithm was implemented in R language and tested on Clostridium beijerinckii NRRL B-598. The bacterium is a typical performer in the field of biofuels production due to its ability to produce butanol. Thanks to that this bacterial organism can be of great potential from an ecological and biotechnologica

  • Název v anglickém jazyce

    OPERON-EXPRESSER: The Innovated Gene Expression-based Algorithm for Operon Structures Inference

  • Popis výsledku anglicky

    Current biotechnological research of bacterial genomes has huge potential due to the use of next-generation sequencing (NGS) platforms. NGS era opens paths for analysis of data for sufficient description of microorganisms with ecology and biotechnology potential in the future. Although some tools for inference of specific structures in bacterial genomes exist, their pipelines and methodologies are often based only on searching bacterial genome databases and comparison with model microorganisms. This paper deals with the design of a new algorithm for operon structures inference in bacterial genomes. The algorithm combines searching in bacterial databases and gene expression information processing. The algorithm was implemented in R language and tested on Clostridium beijerinckii NRRL B-598. The bacterium is a typical performer in the field of biofuels production due to its ability to produce butanol. Thanks to that this bacterial organism can be of great potential from an ecological and biotechnologica

Klasifikace

  • Druh

    O - Ostatní výsledky

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů