Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Characterisation of Waterborne Psychrophilic Massilia Isolates with Violacein Production and Description of Massilia antarctica sp. nov.

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F22%3APU144416" target="_blank" >RIV/00216305:26220/22:PU144416 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61388971:_____/22:00557084 RIV/00216208:11310/22:10447343 RIV/00216224:14310/22:00125595

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.mdpi.com/2076-2607/10/4/704/htm" target="_blank" >https://www.mdpi.com/2076-2607/10/4/704/htm</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms10040704" target="_blank" >10.3390/microorganisms10040704</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Characterisation of Waterborne Psychrophilic Massilia Isolates with Violacein Production and Description of Massilia antarctica sp. nov.

  • Popis výsledku v původním jazyce

    A group of seven bacterial strains producing blue-purple pigmented colonies on R2A agar was isolated from freshwater samples collected in a deglaciated part of James Ross Island and Eagle Island, Antarctica, from 2017-2019. The isolates were psychrophilic, oligotrophic, resistant to chloramphenicol, and exhibited strong hydrolytic activities. To clarify the taxonomic position of these isolates, a polyphasic taxonomic approach was applied based on sequencing of the 16S rRNA, gyrB and lepA genes, whole-genome sequencing, rep-PCR, MALDI-TOF MS, chemotaxonomy analyses and biotyping. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequences revealed that the entire group are representatives of the genus Massilia. The closest relatives of the reference strain P8398(T) were Massilia atriviolacea, Massilia violaceinigra, Massilia rubra, Massilia mucilaginosa, Massilia aquatica, Massilia frigida, Massilia glaciei and Massilia eurypsychrophila with a pairwise similarity of 98.6-100% in the 16S rRNA. The subsequent gyrB and lepA sequencing results showed the novelty of the analysed group, and the average nucleotide identity and digital DNA-DNA hybridisation values clearly proved that P8398(T) represents a distinct Massilia species. After all these results, we nominate a new species with the proposed name Massilia antarctica sp. nov. The type strain is P8398(T) (= CCM 8941(T) = LMG 32108(T)).

  • Název v anglickém jazyce

    Characterisation of Waterborne Psychrophilic Massilia Isolates with Violacein Production and Description of Massilia antarctica sp. nov.

  • Popis výsledku anglicky

    A group of seven bacterial strains producing blue-purple pigmented colonies on R2A agar was isolated from freshwater samples collected in a deglaciated part of James Ross Island and Eagle Island, Antarctica, from 2017-2019. The isolates were psychrophilic, oligotrophic, resistant to chloramphenicol, and exhibited strong hydrolytic activities. To clarify the taxonomic position of these isolates, a polyphasic taxonomic approach was applied based on sequencing of the 16S rRNA, gyrB and lepA genes, whole-genome sequencing, rep-PCR, MALDI-TOF MS, chemotaxonomy analyses and biotyping. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequences revealed that the entire group are representatives of the genus Massilia. The closest relatives of the reference strain P8398(T) were Massilia atriviolacea, Massilia violaceinigra, Massilia rubra, Massilia mucilaginosa, Massilia aquatica, Massilia frigida, Massilia glaciei and Massilia eurypsychrophila with a pairwise similarity of 98.6-100% in the 16S rRNA. The subsequent gyrB and lepA sequencing results showed the novelty of the analysed group, and the average nucleotide identity and digital DNA-DNA hybridisation values clearly proved that P8398(T) represents a distinct Massilia species. After all these results, we nominate a new species with the proposed name Massilia antarctica sp. nov. The type strain is P8398(T) (= CCM 8941(T) = LMG 32108(T)).

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Microorganisms

  • ISSN

    2076-2607

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    10

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    14

  • Strana od-do

    1-14

  • Kód UT WoS článku

    000786017300001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85126958615