Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

FireProtASR: Web Server for Fully Automated Ancestral Sequence Reconstruction

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26230%2F20%3APU138651" target="_blank" >RIV/00216305:26230/20:PU138651 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbaa337/6042664" target="_blank" >https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbaa337/6042664</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/bib/bbaa337" target="_blank" >10.1093/bib/bbaa337</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    FireProtASR: Web Server for Fully Automated Ancestral Sequence Reconstruction

  • Popis výsledku v původním jazyce

    There is a great interest in increasing proteins stability to widen their usability in numerous biomedical and biotechnological applications. However, native proteins cannot usually withstand the harsh industrial environment, since they are evolved to function under mild conditions. Ancestral sequence reconstruction is a well-established method for deducing the evolutionary history of genes. Besides its applicability to discover the most probable evolutionary ancestors of the modern proteins, ancestral sequence reconstruction has proven to be a useful approach for the design of highly stable proteins. Recently, several computational tools were developed, which make the ancestral reconstruction algorithms accessible to the community, while leaving the most crucial steps of the preparation of the input data on users side. FireProtASR aims to overcome this obstacle by constructing a fully automated workf low, allowing even the unexperienced users to obtain ancestral sequences based on a sequence query as the only input. FireProtASR is complemented with an interactive, easy-to-use web interface and is freely available at https://loschmidt.chemi.muni.cz/fireprotasr/.

  • Název v anglickém jazyce

    FireProtASR: Web Server for Fully Automated Ancestral Sequence Reconstruction

  • Popis výsledku anglicky

    There is a great interest in increasing proteins stability to widen their usability in numerous biomedical and biotechnological applications. However, native proteins cannot usually withstand the harsh industrial environment, since they are evolved to function under mild conditions. Ancestral sequence reconstruction is a well-established method for deducing the evolutionary history of genes. Besides its applicability to discover the most probable evolutionary ancestors of the modern proteins, ancestral sequence reconstruction has proven to be a useful approach for the design of highly stable proteins. Recently, several computational tools were developed, which make the ancestral reconstruction algorithms accessible to the community, while leaving the most crucial steps of the preparation of the input data on users side. FireProtASR aims to overcome this obstacle by constructing a fully automated workf low, allowing even the unexperienced users to obtain ancestral sequences based on a sequence query as the only input. FireProtASR is complemented with an interactive, easy-to-use web interface and is freely available at https://loschmidt.chemi.muni.cz/fireprotasr/.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS

  • ISSN

    1467-5463

  • e-ISSN

    1477-4054

  • Svazek periodika

    0000

  • Číslo periodika v rámci svazku

    0000

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    1-11

  • Kód UT WoS článku

    000709466800097

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85100417173