Ověřená proteomická analytická metoda

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F02970228%3A_____%2F23%3AN0000007" target="_blank" >RIV/02970228:_____/23:N0000007 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.cfplus.cz/" target="_blank" >https://www.cfplus.cz/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Ověřená proteomická analytická metoda

Popis výsledku v původním jazyce

V rámci projektu byl optimalizován proces analýzy povrchově značených proteinů, sestávající se z izolace modifikovaného proteinu, jeho enzymatického štěpení na menší fragmenty, jejich analýze, z nichž vyplyne, v kterých štěpech je přítomna fluorovaná značka a kde ne. Následně jsou tyto data interpretována a z nich je vykreslena 3D-struktura studovaného proteinu, popřípadě je objasněna identita domén, které se podílejí na interakci dvou proteinů. Ověření bylo provedeno na vybraném biologicky relevantním proteinu, resp. protein-proteinového komplexu, jehož struktura 3D-struktura/povaha interakce je dobře známa a popsána jinými metodami, jako je např. krystalografie, HD výměna nebo značení OH radikály. Vykreslení identické povrchové mapy, respektive identického protein-proteinového rozhraní, jaké je známo díky použití jiné referenční metody bude považováno za úspěšné ověření technologie.

Název v anglickém jazyce

A validated proteomic analytical method

Popis výsledku anglicky

As part of the project, the process of analyzing surface-labeled proteins was optimized, consisting of the isolation of the modified protein, its enzymatic cleavage into smaller fragments, and their analysis, which shows in which grafts a fluorinated label is present and where it is not. Subsequently, these data are interpreted and the 3D structure of the studied protein is drawn from them, or the identity of the domains involved in the interaction of two proteins is clarified. The verification was performed on a selected biologically relevant protein, or of a protein-protein complex whose 3D-structure/nature of interaction is well known and described by other methods such as crystallography, HD exchange or OH radical labeling. Rendering an identical surface map, or an identical protein-protein interface, as known using another reference method will be considered a successful validation of the technology.

Druh

Z_tech - Ověřená technologie

CEP obor

—

OECD FORD obor

30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])

Projekt

<a href="/cs/project/EG21_374%2F0026531" target="_blank" >EG21_374/0026531: Výzkum a vývoj inovativních metod pro charakterizaci a biokonjugaci proteinů (CF PROT)</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Ověřená proteomická analytická metoda

Číselná identifikace

—

Technické parametry

V rámci projektu byl optimalizován proces analýzy povrchově značených proteinů, sestávající se z izolace modifikovaného proteinu, jeho enzymatického štěpení na menší fragmenty, jejich analýze, z nichž vyplyne, v kterých štěpech je přítomna fluorovaná značka a kde ne. Následně jsou tyto data interpretována a z nich je vykreslena 3D-struktura studovaného proteinu, popřípadě je objasněna identita domén, které se podílejí na interakci dvou proteinů. Ověření bylo provedeno na vybraném biologicky relevantním proteinu, resp. protein-proteinového komplexu, jehož struktura 3D-struktura/povaha interakce je dobře známa a popsána jinými metodami, jako je např. krystalografie, HD výměna nebo značení OH radikály. Vykreslení identické povrchové mapy, respektive identického protein-proteinového rozhraní, jaké je známo díky použití jiné referenční metody bude považováno za úspěšné ověření technologie.

Ekonomické parametry

Hlavním ekonomickým přínosem nově vyvinutýhc vodorozpustných Togniho-CF3 činidel je primárně prodej vytvořených kitů a licencování na ně navázané technologie pro firemní užití, v případě rozšířeného scénáře je to možnost tvorby strategických partnerství s firmami aktivními v oblasti zakázkové proteinové charakterizace.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

02970228

Název vlastníka

CF Plus Chemicals s.r.o.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

A - K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence

Požadavek na licenční poplatek

A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek

Adresa www stránky s výsledkem

https://www.cfplus.cz/