Real-time PCR detekce virů Little cherry virus 1 (LChV-1) a Little cherry virus 2 (LChV-2) v biologickém materiálu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F18%3AN0000045" target="_blank" >RIV/25271121:_____/18:N0000045 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.vsuo.cz/common/cms_files/02_Real_time_PCR_detekce_viru_LChV_1_a_LChV_2_v_biologickem_materialu.pdf" target="_blank" >http://www.vsuo.cz/common/cms_files/02_Real_time_PCR_detekce_viru_LChV_1_a_LChV_2_v_biologickem_materialu.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Real-time PCR detekce virů Little cherry virus 1 (LChV-1) a Little cherry virus 2 (LChV-2) v biologickém materiálu

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem metodiky je zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů LChV-1 a LChV-2, které jsou původci virového onemocnění maloplodost třešně (LChD – Little Cherry Disease). Hostitelskými rostlinami těchto virů jsou zejména třešně a višně. Výskyt LChV-1 byl popsán také na slivoních, broskvoních a mandloních. Choroba způsobuje významné ztráty na výnosu zejména třešní a višní. Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci obou virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v simplexním/multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu metodiky EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98(2) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu.

Název v anglickém jazyce

Real-time PCR detection of Little cherry virus 1 (LChV-1) and Little cherry virus 2 (LChV-2) in biological material

Popis výsledku anglicky

The aim of this method is to implement a new detection system for a routine diagnostics of plant viruses LChV-1 and LChV-2 that cause Little Cherry Disease (LChD), especially in sweet and sour cherries as the main hosts, leading to significant economic losses. The LChV-1 was also described in plum, peach and almond trees. The detection method is based on real-time PCR; this approach allows simultaneous qualitative/quantitative detection of both viruses in one reaction. The detection system was validated in simplex and multiplex arrangements with the use of Rotor-Gene Q cycler (Qiagen) according to the validation scheme EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98(2) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. The detection system may be preferably used for routine diagnostics of LChV-1 and LChV-2 during propagation material certification procedures.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

10609 - Biochemical research methods

Projekt

<a href="/cs/project/LO1608" target="_blank" >LO1608: Výzkumné ovocnářské centrum</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

978-80-87030-57-8

Číslo předpisu

UKZUZ 117978/2018

Technické parametry

Osvědčení pod č.j. UKZUZ 117978/2018 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Brno. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s ÚKZÚZ

Ekonomické parametry

Metodika pro diagnostiku virů LChV-1 a LChV-2 metodou real-time PCR je optimalizována pro současnou detekci obou virů v jedné PCR reakci. Metodika tedy zrychluje, zpřesňuje a zlevňuje jejich diagnostiku. Zpracuje se tak s vyšší citlivostí za stejný čas větší množství vzorků za nižší cenu, sníží se náklady na jednu analýzu, zvýší se příjmy z testů nebo uvolní kapacita laboratoře. Rychlejší odezva laboratoře bude mít též pozitivní dopad na ekonomiku žadatele o vyšetření zdravotního stavu ovocných plodin, neboť může získat výsledky v kratším čase, a tak pružněji reagovat na obdržené výsledky. Odhad ekonomického přínosu pro tyto žadatele je těžko vyčíslitelný, bude záležet na rozsahu nákazy a rychlosti odezvy laboratoře provádějící testy. Další, ekonomicky obtížně vyčíslitelný, pozitivní dopad bude mít využití metodiky pro testování rozmnožovacího materiálu, kdy včasnou detekcí případných pozitivních rostlin bude zabráněno šíření virů množitelským materiálem a tím i budoucím ztrátám na výnosu v dalších letech.

Označení certifikačního orgánu

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů