Metodika detekce genů rezistence Rvi2, Rvi4 a Rvi6 k Venturia inaequalis a jejich pyramidizace pro zavedení selekce jabloní asistované molekulárními markery

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F22%3AN0000055" target="_blank" >RIV/25271121:_____/22:N0000055 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://vsuo.cz/images/FILES/Metodiky/rsk_Metodika_detekce_gen_rezistence_Venturia_Inq_2022.pdf" target="_blank" >https://vsuo.cz/images/FILES/Metodiky/rsk_Metodika_detekce_gen_rezistence_Venturia_Inq_2022.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Metodika detekce genů rezistence Rvi2, Rvi4 a Rvi6 k Venturia inaequalis a jejich pyramidizace pro zavedení selekce jabloní asistované molekulárními markery

Popis výsledku v původním jazyce

Jabloň domácí (Malus × domestica Borkh.) je důležitou zemědělskou komoditou, může však trpět různými chorobami, které snižují produkci komerčně uplatnitelných plodů. Mezi nejzávažnější patří strupovitost jabloně, jejímž původcem je houbový patogen Venturia ineaqualis. Šlechtění odrůd rezistentních vůči tomuto patogenu je proto v popředí šlechtitelských programů mnoha zemí světa, jelikož kombinace použití odolných odrůd jabloní s technologickými opatřeními v sadech umožnuje snížit spotřebu fungicidů k regulaci tohoto patogenu. Vzhledem k tomu, že v současné době je tato rezistence kódovaná tzv. Rvi geny překonávána různými rasami patogenu, dosažení trvalé rezistence je možné jen kombinací různých genů Rvi, tzv. pyramidizací genů. Avšak zda k této kumulaci genů Rvi došlo, není na úrovni fenotypu téměř možné rozpoznat. Pro průkaz přenosu genů rezistence vůči V. inaequalis jsou proto vyvíjeny genetické markery, které umožňují jednoduchou selekci rezistentních jabloní. Použitím markery asistované selekce je možné odstranit neperspektivní hybridní potomstvo bez náročného pěstování a testování již v prvním roce života. V poslední době byly validovány SNP markery pro lokusy Rvi2, Rvi4 a Rvi6, jejichž detekce je popsána v této metodice. Detekce těchto markerů rezistence byla provedena třemi metodami, a to sekvenováním, metodou alelické diskriminace pomocí real-time PCR a metodou SNaPshot.

Název v anglickém jazyce

Methodology for the detection of Rvi2, Rvi4 and Rvi6 resistance genes to Venturia inaequalis and their pyramiding for the introduction of marker-assisted selection in apple trees

Popis výsledku anglicky

Domestic apple (Malus × domestica Borkh.) is an important agricultural commodity, but it suffers from various diseases that can reduce the production of commercially applicable fruits. One of the most serious diseases is a scab, which is caused by the fungal pathogen Venturia ineaqualis. Breeding of cultivars resistant to this pathogen is therefore at the forefront of breeding programs in many countries worldwide. The combination of resistant apple cultivars usage with technological procedures in orchards makes it possible to reduce the fungicide consumption to control this pathogen. Due to the fact that this resistance encoded by so called Rvi genes is currently overcome by different races of the pathogen, the achievement of durable resistance is possible only by a combination of different resistance genes, so-called pyramidization of genes. However, whether this accumulation of Rvi genes has occurred is almost impossible to discern at the phenotype level. Therefore, genetic markers are being developed to demonstrate the transmission of V. inaequalis resistance genes to the progeny, which allow easy selection of resistant apple trees. By using marker-assisted selection, it is possible to remove unpromising hybrid offspring without demanding cultivation and testing in the first year of life. Recently, SNP markers for the Rvi2, Rvi4 and Rvi6 resistance genes have been validated and their detection is described in this methodology. Detection of these resistance markers was performed by three methods, namely sequencing, allelic discrimination using real-time PCR, and SNaPshot.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming

Projekt

<a href="/cs/project/TJ04000389" target="_blank" >TJ04000389: Inovace detekce genů rezistence ke strupovitosti jabloně a jejich pyramidizace pomocí molekulárních markerů</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

ISBN 978-80-87030-85-1

Číslo předpisu

UKZUZ 093233/2022

Technické parametry

Osvědčení pod č.j. UKZUZ 093233/2022 o uznání metodiky v souladu s podmínkami Metodiky hodnocení výzkumných organizací a programů účelové podpory výzkumu, vývoje a inovací, schválené usnesením vlády dne 8. února 2017, číslo 107 a její samostatné přílohy č. 4 schválené usnesením vlády dne 29. listopadu 2017 č. 837 vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s Ústavem experimentální botaniky Akademie věd České republiky, v. v. i. se sídlem Rozvojová 263, 165 02 Praha 6 – Lysolaje.

Ekonomické parametry

Využití molekulárních markerů vede k přesné charakterizaci genových zdrojů rezistence jabloní, což přispívá ke zvýšení efektivnosti šlechtitelského procesu. V procesu MAS jsou genotypy, které nenesou požadovaný znak, vyloučeny již ve stádiu semenáčků, dochází tak k úsporám prostoru, který je potřeba pro pěstování, úsporám času a jiných prostředků, které jsou potřeba na obhospodařování daných stromků, a tedy k úsporám také finančním. Dalším přínosem je možnost identifikace šlechtitelsky velmi cenných genotypů se dvěma rezistentními alelami téhož genu, které v dalším křížení budou poskytovat 100 % rezistentního potomstva. Tato metodika má sloužit k zefektivnění a zjednodušení šlechtění jabloní odolných vůči strupovitosti, dalším ekonomickým přínosem je tak nižší spotřeba pesticidů potřebných k obhospodařování sadu s těmito odrůdami. Díky tomu dochází i ke snížení ekologické zátěže pro životní prostředí a klesá riziko výskytu zdraví škodlivých reziduí pesticidů v potravním řetězci.

Označení certifikačního orgánu

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů