Molekulárními markery asistované šlechtění třešně ptačí (Prunus avium L.) – selekce na dobu sklizňové zralosti, velikost, barvu a pevnost plodů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F23%3AN0000084" target="_blank" >RIV/25271121:_____/23:N0000084 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://doi.org/10.60615/a01h-d866" target="_blank" >https://doi.org/10.60615/a01h-d866</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Molekulárními markery asistované šlechtění třešně ptačí (Prunus avium L.) – selekce na dobu sklizňové zralosti, velikost, barvu a pevnost plodů

Popis výsledku v původním jazyce

Šlechtění třešní je zdlouhavý a finančně i prostorově náročný proces vyžadující velký objem lidské práce. Cílem této metodiky je poskytnutí unikátního nástroje pro predikci hned několika šlechtitelsky důležitých vlastností, jakými jsou doba sklizňové zralosti, respektive velikost, barva a pevnost plodu, kdy použití metod molekulární genetiky umožní odstranění neperspektivních semenáčů již v prvním vegetačním roce, aniž by musely být dopěstovány do plodnosti. Analýza markerů pro tyto znaky může proběhnout v jediné reakci zde popsanou metodou tzv. Single Base Extension (SBE), kdy pro ni byly vybrány nejvýznamnější SNP identifikované metodou GWAS založenou na celogenomovém sekvenování. Predikční schopnost uvedených molekulárních markerů je v této metodice porovnána s dříve používanými markery pro velikost a barvu plodů. I pro tyto markery je v metodice popsán pracovní postup jejich detekce. V neposlední řadě přináší metodika popis genotypů jednotlivých markerů u vybraných odrůd vhodných do šlechtitelských programů se zaměřením na zkvalitnění uvedených vlastností.

Název v anglickém jazyce

Molecular marker-assisted breeding of sweet cherry (Prunus avium L.) – selection for the time of harvest maturity, size, color and firmness of fruits

Popis výsledku anglicky

Breeding cherries is a lengthy, financially and spatially demanding process that requires a large amount of human work. The aim of this methodology is to provide a unique tool for the prediction of several breeding-important characteristics, such as the time of harvest maturity, size, color and firmness of the fruit, when the use of molecular genetics methods will allow the removal of unpromising seedlings already in the first growing year, without having to be grown to fertility . The analysis of markers for these traits can take place in a single reaction using the Single Base Extension (SBE) method described here, when the most significant SNPs identified by the GWAS method based on whole-genome sequencing were selected for it. The predictive ability of the mentioned molecular markers is compared in this methodology with previously used markers for fruit size and color. Even for these markers, their detection workflow is described in the methodology. Last but not least, the methodology provides a description of the genotypes of individual markers in selected cultivars suitable for breeding programs with a focus on improving the quality of the mentioned properties.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910290" target="_blank" >QK1910290: Rozvoj a aplikace molekulárně genetických metod pro racionalizaci šlechtitelských postupů třešní (Prunus avium L.)</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

978-80-87030-97-4

Číslo předpisu

UKZUZ 213622/2023

Technické parametry

Osvědčení pod č.j. UKZUZ 213622/2023 o uznání této metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský. Smlouva o uplatnění metodiky byla uzavřena s Ovocnářskou unií ČR, z.s. se sídlem Holovousy 129, 50801 Holovousy, IČ 44477325 dne 7. 11. 2023.

Ekonomické parametry

Přínos MAS se bude lišit podle jednotlivých pracovišť a s ohledem na rozsah a cíle šlechtitelských programů. Washington State University odhadla, že použitím MAS ušetřila v letech 2010 a 2011 celkem 75-80 000 USD odstraněním více jak poloviny z téměř 3 000 třešňových semenáčů coby neperspektivních, úspora tedy byla cca 1 200 Kč na odstraněný semenáček (Peace, 2017; Sebolt, 2011). V následujících dvou letech to bylo více jak 80 000 USD, když bylo zachováno pouze 15 % perspektivních semenáčů z cca 3 400 rostlin (úspora cca 620 Kč/semenáč; Edge-Garza, 2014). Úspory z použití MAS ve šlechtění ovocných dřevin byly kalkulovány i pro jabloně, kdy bylo publikováno, že MAS je v programu jejich šlechtění nákladově efektivní, pokud je odstraněno více než 12 % neperspektivních hybridů (Wannemuehler, 2019). Lze předpokládat, že náklady na udržování semenáčů budou obdobné i v České republice.

Označení certifikačního orgánu

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů