Diagnostics of Ramularia collo-cygni in barley seed using real-time PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25328859%3A_____%2F11%3AN0000005" target="_blank" >RIV/25328859:_____/11:N0000005 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00027006:_____/11:00001891

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

slovinština

Název v původním jazyce

Diagnostika Ramularia collo-cygni v semenách jačmeňa pomocou real-time PCR

Popis výsledku v původním jazyce

Ramularia collo-cygni (RCC) je patogen jarního i ozimého ječmene způsobující Ramulariovou skvrnitost ječmene (RLS). Cílem této práce bylo identifikovat RCC v zrnu pomocí real-time PCR. PCR primery a TaqMan sonda byly navrženy na základě DNA sequence specifické pro RCC. Zrno bylo rozděleno na lemmu, oplodí, osemení, endosperm a embryo a jednotlivé části byly testovány zvlášť. DNA RCC bylo detekováno nejvíce v lemmě, v menší míře v oplodí, embryu a ve vodě použité pro oplach zrna. Výsledky ukázaly, že RCCneprochází osemením do endospermu. Bylo rovněž potvrzeno, že úroveň kontaminace osiva nemá hlavní vliv na vznik symptomů choroby.

Název v anglickém jazyce

Diagnostics of Ramularia collo-cygni in barley seed using real-time PCR

Popis výsledku anglicky

Ramularia collo-cygni (RCC) is a pathogen of spring and winter barley which causes the disease Ramularia leaf spot (RLS). This study aimed to identify the location of RCC in the grain using quantitative methods for the detection of the pathogen based on real-time PCR. PCR primers and a TaqMan probe were designed to target the RCC-specific DNA sequence. After washing, kernels were dissected into lemma, pericarp, testa, endosperm, and embryo which were individually tested by real-time PCR. Ramularia DNA was detected in the highest amount in lemma, and occurred in lower amounts in the pericarp, embryo, and in the water used for washing the kernels also. The results showed that RCC does not penetrate through the testa into the endosperm. It was also confirmed that the level of seed contamination is not the main factor influencing symptom expression.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

40500 - Other agricultural sciences

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Nové poznatky z genetiky a šľachtenia poľnohospodárskych rastlín

ISBN

978-80-89417-29-2

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

136-138

Název nakladatele

Centrum výskumu rastlinnej výroby Piešťany

Místo vydání

Piešťany

Místo konání akce

Piešťany

Datum konání akce

1. 1. 2011

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—