Bioinformatická analýza ? určení širšího spektra kandidátních biomarkerů
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25548611%3A_____%2F14%3A%230000653" target="_blank" >RIV/25548611:_____/14:#0000653 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Bioinformatická analýza ? určení širšího spektra kandidátních biomarkerů
Popis výsledku v původním jazyce
Na základě bioinformatické analýzy bylo vybráno 22 kandidátních biomarkerů karcinomu prostaty. Kromě biomarkerů PSP94 a KLK2, které byly definovány jako modelové biomarkery v přihlášce projektu AFFIBINDER, pro produkci geneticky značených rekombinantníchfragmentů byly vybrány tyto kandidátní biomarkery KLK3, KLK11, PLAUR, PLAU, IGF-1, IGFBP2, IGFBP3, HPN, PSCA. Geny vybraných biomarkerů kódují strukturně podobné dvojice silně homologních proteinů a jsou zde zastoupené jak sekretované molekuly, tak i transmembránové receptory. Tento výběr zohledňuje jejich použití v multiplexní diagnostice karcinomu prostaty. Všechny kandidátní biomarkery byly potvrzeny v nově publikovaných článcích jako relevantní pro karcinom prostaty (2011-2012).
Název v anglickém jazyce
Bioinformatic Analysis - Determination of wide spectrum of candidate biomarkers
Popis výsledku anglicky
Based on the bioinformatic analysis, 22 candidate biomarkers of prostate cancer were selected. In addition to biomarkers PSP94 and KLK2, which were defined in AFFIBINDER projekt application as model biomarkers , following candidate biomarkers were selected for producing genetically tagged recombinant fragments - KLK3, KLK11, PLAUR, PLAU, IGF-1, IGFBP2, IGFBP3, HPN, PSCA. Selected biomarkers genes encode structurally similar pairs of strongly homologous proteins and represent both secreted molecules andtransmembrane receptors. This choice reflects their use in multiplexed diagnosis of prostate cancer. All candidate biomarkers were confirmed in a recently published articles as relevant for prostate cancer (2011-2012).
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
EI - Biotechnologie a bionika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/FR-TI4%2F667" target="_blank" >FR-TI4/667: *Vývoj nových vazebných biomolekul pro in vitro diagnostické použití v onkologii</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů