Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26296080%3A_____%2F14%3A%230001189" target="_blank" >RIV/26296080:_____/14:#0001189 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14310/14:00073263

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního

Popis výsledku v původním jazyce

Metodický postup a řešení se týká navržení sady mikrosatelitních markerů ve specifických genech Trifolium pratense (jetel luční) definovaných na základě vlastního sekvenování další generace. Zahrnuje druhově specifické SSR markery v kódujících sekvencích(exonech) genů pro desaturázy, polyfenoloxidázy a noduliny, které jsou součástí metabolických drah biosyntézy mastných kyselin, důležitých pro kvalitu bílkovin a pro fixaci dusíku, a dále zahrnuje SSR markery v genech pro rezistenci a pro výnosové charakteristiky. Metodika se také vztahuje k postupu amplifikace cílových sekvencí SSR markerů pomocí specifických sond. Testovací sada mikrosatelitních markerů je určena pro oblast šlechtění jetele lučního.

Název v anglickém jazyce

Detection of gene-specific microsatellite markers red clover

Popis výsledku anglicky

Methodological approach and solution relates to propose a set of microsatellite markers in specific genes Trifolium pratense (red clover), defined on the basis of its own next-generation sequencing. Includes species-specific SSR markers in the coding sequences (exons) desaturase genes, polyphenol and noduliny which are part of the metabolic pathways of biosynthesis of fatty acids that are important for the quality of the protein and for nitrogen fixation, and further comprising the SSR markers in genesfor resistance and yield characteristics . The methodology also relates to a method of amplification of target sequences of SSR markers using specific probes. The test set of microsatellite markers is intended for the breeding of red clover

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QI111A019" target="_blank" >QI111A019: Nové genomické postupy pro šlechtění cizosprašných plodin na zlepšení užitkových vlastností</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Metodika 25/14

Číslo předpisu

A

Technické parametry

Metodika bude využita v oblasti diagnostiky genotypů jetele pro získání nových zdrojů diverzity využitelných při tvorbě nového šlechtitelského materiálu pro vyšlechtění odrůdy s požadovanými hospodářskými znaky jako je odolnost k patogenům, zlepšená fixace dusíku a vyšší obsah polyfenoloxidáz důležitých pro výživářské parametry. Diagnostické markery jsou funkční (kauzální) markery v cílových genech. Takové soubory SSR markerů jetele je možné využít v populačních studiích ve šlechtění jetele lučního při1) charakterizaci rozsáhlých kolekcí genových bank pro vyloučení duplicit, 2) odlišení odrůd, 3) asociačních studiích a detekci markerů v genetické vazbě s hospodářsky významnými geny (MAS; marker assisted selection).

Ekonomické parametry

Metodika vychází z potřeby maximálně optimalizovat šlechtitelský proces, protože tvorba nových odrůd jetele lučního je dlouhodobá záležitost. Hlavním záměrem je uplatnění nových metod skríningu a diagnostiky ve šlechtění jetele lučního založených na molekulárně genetických metodách. Aplikace těchto metod bude znamenat zvýšení efektivnosti šlechtění, jeho výrazné urychlení a tím i ekonomický efekt.

Označení certifikačního orgánu

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Hroznová 2, 656 02 Brmo

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů