Sledování onkologické léčby solidních nádorů s využitím oncomonitoru – rychlé a citlivé metody tekuté biopsie

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26475821%3A_____%2F21%3AN0000002" target="_blank" >RIV/26475821:_____/21:N0000002 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Sledování onkologické léčby solidních nádorů s využitím oncomonitoru – rychlé a citlivé metody tekuté biopsie

Popis výsledku v původním jazyce

Využití volné nádorové DNA jako alternativního zdrojového materiálu pro molekulární vyšetření je dnes součástí diagnostiky solidních nádorů. Jedná se především o situace, kdy standardní vzorek tkáně není dostupný, případně jeho vyšetření nepřineslo konkluzivní výsledek, a kde „tekutá biopsie” může nahradit standardní biopsii tkáňovou. Poté, co je ctDNA intenzivně zkoumána již více než 10 let, je nepochybné, že mutační profily detekované v ctDNA velmi spolehlivě kopírují molekulární stav uvnitř nádorových buněk. V poslední době je též stále jasnější i to, že množství uvolňované ctDNA je úměrné množství rozpadajících se nádorových buněk, které odráží celkový objemu nádorové masy označovaný jako nádorová zátěž .Z pohledu klinické onkologie to přináší velmi zajímavé možnosti, neboť hladiny ctDNA tak přímo korelují s rozsahem onemocnění a to i vzhledem k případněabsolvované či probíhající terapii. Průběžné sledování úspěšnosti onkologické léčby na základě dynamiky ctDNA se tak stává významným nástrojem v klinickém managementu solidních nádorů. Základní faktory defi nující klinické využití diagnostického přístupu jsou jeho spolehlivost, metodická náročnost a náklady. V oblasti jednorázově prováděné diagnostické tekuté biopsie je klíčové zajistit co nejširší spektrum vyšetřovaných mutací i za cenu poněkud vyšších nákladů na specializované postupy sekvenování nové generace (next-generation sequencing, NGS). Oproti tomu pro klinické využití ctDNA pro monitorování průběhu léčby na základě jejího opakovaného vyšetřování je při zachování dostatečné spolehlivosti (vysoká citlivost i specifi ta) velmi důležité udržení nízkých nákladů. Většina současných přístupů pro sledování hladin ctDNA na základě cílené detekce předem známých mutací je založeno na alelicky specifické amplifikaci mutovaných fragmentů v režimu kvantitativní PCR (qPCR) nebo digitální PCR (ddPCR). Použitelnost těchto postupů je však omezena pouze na detekce mutací lokalizovaných v tzv. hotspotech, což bývá typicky případ mutovaných onkogenů (např. KRAS, BRAF, EGFR apod.) Na našem pracovišti jsme v průběhu řady let vyvinuli metodu, která je univerzálně použitelná pro mutace v širším úseku DNA a je tak vhodná i pro detekci mutovaných tumor supresorů (např. TP53, APC, BRCA1-2 apod.). Tato metodika byla pod označením oncoMonitor optimalizována a validována a v příspěvku budou předvedeny možnosti jejího využití u pokročilého kolorektálního karcinomu a nemalobuněčného karcinomu plic.

Název v anglickém jazyce

Monitoring of oncological treatment of solid tumors using the oncomonitor – fast and sensitive liquid biopsy method

Popis výsledku anglicky

The use of free tumor DNA as an alternative source material for molecular examination is now part of the diagnosis of solid tumors. These are mainly situations where a standard tissue sample is not available, or its examination did not yield a conclusive result, and where a "liquid biopsy" can replace a standard tissue biopsy. After ctDNA has been intensively studied for more than 10 years, it is beyond doubt that the mutational profiles detected in ctDNA very reliably replicate the molecular state inside tumor cells. Recently, it has also become increasingly clear that the amount of ctDNA released is proportional to the amount of disintegrating tumor cells, which reflects the total volume of the tumor mass, referred to as tumor burden. From the point of view of clinical oncology, this brings very interesting possibilities, since the levels of ctDNA are directly correlated with by the extent of the disease, also due to the completed or ongoing therapy. Continuous monitoring of the success of oncological treatment based on ctDNA dynamics thus becomes an important tool in the clinical management of solid tumors. The basic factors defining the clinical use of the diagnostic approach are its reliability, methodological complexity and costs. In the field of one-time diagnostic liquid biopsy, it is crucial to ensure the widest possible spectrum of investigated mutations, even at the cost of somewhat higher costs for specialized next-generation sequencing (NGS) procedures. In contrast, for the clinical use of ctDNA for monitoring the course of treatment based on its repeated examination, it is very important to maintain low costs while maintaining sufficient reliability (high sensitivity and specificity). Most current approaches for monitoring ctDNA levels based on targeted detection of previously known mutations are based on allele-specific amplification of mutated fragments in quantitative PCR (qPCR) or digital PCR (ddPCR) mode. However, the applicability of these procedures is limited only to the detection of mutations localized in so-called hotspots, which is typically the case of mutated oncogenes (e.g. KRAS, BRAF, EGFR, etc.). in a wider section of DNA and is thus also suitable for the detection of mutated tumor suppressors (e.g. TP53, APC, BRCA1-2, etc.). This methodology has been optimized and validated under the name oncoMonitor, and the contribution will demonstrate the possibilities of its use in advanced colorectal cancer and non-small cell lung cancer.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

30204 - Oncology

Projekt

<a href="/cs/project/NV17-30748A" target="_blank" >NV17-30748A: Nová metoda kombinace funkčních zobrazovacích metod a nádorové genomiky pro neinvazivní fenotypizaci a sledování efektu léčby plicních karcinomů</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Klin Onkol 2021

ISBN

—

ISSN

0862-495X

e-ISSN

1802-5307

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

—

Název nakladatele

Care Comm s.r.o.

Místo vydání

Praha

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

1. 1. 2021

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—