Využitelnost vysoce kopiových retrotransposonových elementů Ogre a cyclop pro molekulární genotypizaci kolekce hrachu.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26784246%3A_____%2F04%3A%230000005" target="_blank" >RIV/26784246:_____/04:#0000005 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Utility of high copy number Ogre/Cyclop retrotransposons for molecular genotyping of pea (Pisum sativum L.) germplasm.

Popis výsledku v původním jazyce

We have used two highly abundant retrotransposons, representative one of the major group of long terminal repeats (LTR) - containing retrotransposons of Ty3/gypsy-like class, Ogre and Cyclop, for development of molecular markers for pea cultivars genotyping. The aim of this study was to access retrotransposon based markers to evaluate the genetic diversity of pea (Pisum sativum L.). To test the utility and reliability of the method we have chosen 20 commercially used pea cultivars with well known pedegree. Due to the sequence knowledge, IRAP markers are better scorable and result in more accurate genetic distance estimations over the REMAP, ISSR and RAPD techniques. With the use of just two outward-facing primers annealing to LTR Ogre and Cyclop targetsequences 56 and 43 polymorphic bands per cultivar and reaction were produced which clearly distinguished and separated 20 investigated pea cultivars into groups related to known pedegree.

Název v anglickém jazyce

Utility of high copy number Ogre/Cyclop retrotransposons for molecular genotyping of pea (Pisum sativum L.) germplasm.

Popis výsledku anglicky

We have used two highly abundant retrotransposons, representative one of the major group of long terminal repeats (LTR) - containing retrotransposons of Ty3/gypsy-like class, Ogre and Cyclop, for development of molecular markers for pea cultivars genotyping. The aim of this study was to access retrotransposon based markers to evaluate the genetic diversity of pea (Pisum sativum L.). To test the utility and reliability of the method we have chosen 20 commercially used pea cultivars with well known pedegree. Due to the sequence knowledge, IRAP markers are better scorable and result in more accurate genetic distance estimations over the REMAP, ISSR and RAPD techniques. With the use of just two outward-facing primers annealing to LTR Ogre and Cyclop targetsequences 56 and 43 polymorphic bands per cultivar and reaction were produced which clearly distinguished and separated 20 investigated pea cultivars into groups related to known pedegree.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Genetic Variation for Plant Breeding

ISBN

3-900962-56-1

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

326

Název nakladatele

BOKU University, Tull

Místo vydání

Vienna, Rakousko

Místo konání akce

Tulln , Rakousko

Datum konání akce

1. 1. 2004

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—