Vývoj retrotransposonového markerovacího systému pro analýzu genetické diverzity genofondové kolekce lnu setého (LINUM USSITATISSIMUM L.).

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26784246%3A_____%2F07%3A%230000049" target="_blank" >RIV/26784246:_____/07:#0000049 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

DEVELOPMENT OF RETROTRANSPOSON-BASED MARKER SYSTEM FOR GENETIC DIVERSITY CHARACTERIZATION OF FLAX (LINUM USSITATISSIMUM L.) AGRITEC LTD. GERMPLASM.

Popis výsledku v původním jazyce

The goal of this study was to develop a molecular marker system for Linum based on retrotransposons and used it to germplasm diversity evaluation and flax core collection development. 75 PCR primers were designed and tested in IRAP (Inter RetrotransposonAmplified Polymorphism) protocol.We have identified 27 primers that displayed clear banding patterns and useful levels of polymorphism, yielding multiloci fingerprint. 23 primers have produced low multiloci pattern, but can be further combined. In summary, use of 3 to 4 single primer IRAP protocol have potential fully discriminate and identify tested set of 50 flax varieties. Based on primer used, 15 to 30 (100 to 3500 bp) PCR amplified fragments can be visualized, of which 5 to 25% was polymorphic eg.informative. All these results are used in further work aiming at core collection development from current over 2.000 accessions of flax collection hold at Agritec Ltd.

Název v anglickém jazyce

DEVELOPMENT OF RETROTRANSPOSON-BASED MARKER SYSTEM FOR GENETIC DIVERSITY CHARACTERIZATION OF FLAX (LINUM USSITATISSIMUM L.) AGRITEC LTD. GERMPLASM.

Popis výsledku anglicky

The goal of this study was to develop a molecular marker system for Linum based on retrotransposons and used it to germplasm diversity evaluation and flax core collection development. 75 PCR primers were designed and tested in IRAP (Inter RetrotransposonAmplified Polymorphism) protocol.We have identified 27 primers that displayed clear banding patterns and useful levels of polymorphism, yielding multiloci fingerprint. 23 primers have produced low multiloci pattern, but can be further combined. In summary, use of 3 to 4 single primer IRAP protocol have potential fully discriminate and identify tested set of 50 flax varieties. Based on primer used, 15 to 30 (100 to 3500 bp) PCR amplified fragments can be visualized, of which 5 to 25% was polymorphic eg.informative. All these results are used in further work aiming at core collection development from current over 2.000 accessions of flax collection hold at Agritec Ltd.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2007

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Plant Genetic Resources and Their Exploitation in the Plant Breeding for Food and agriculture.

ISBN

978-80-88872-63-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

159

Název nakladatele

—

Místo vydání

Piešťany, Slovensko

Místo konání akce

Piešťany, Slovensko

Datum konání akce

1. 1. 2007

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—