Asociační analýza (GWAS) odrůd a klonů mezirodového křížence ×Festulolium a identifikace SNP markerů pro genomickou selekci hospodářsky významných znaků

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26791251%3A_____%2F21%3AN0000016" target="_blank" >RIV/26791251:_____/21:N0000016 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vupt.cz/cz/casopis-uroda" target="_blank" >https://www.vupt.cz/cz/casopis-uroda</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Asociační analýza (GWAS) odrůd a klonů mezirodového křížence ×Festulolium a identifikace SNP markerů pro genomickou selekci hospodářsky významných znaků

Popis výsledku v původním jazyce

U odrůd a klonů mezirodového křížence ×Festulolium byla provedena asociační analýza (GWAS) za účelem vzniku sady asociovaných SNP markerů s vybranými specifickými agronomicky významnými znaky (odolnost vůči suchu, šířka listů vegetativních odnoží, odolnost vůči vyzimování, odolnost vůči mrazu, začátek sloupkování, začátek metání, tvar trsu ve vegetativním stavu, odolnost vůči paličkovici nachové, odolnost vůči rzím, odolnost vůči endofytním houbám, výnos suché hmoty) a kvalitativními znaky (obsah N-látek, stravitelnost organické hmoty). V OZ Výzkumné stanici travinářské Rožnov-Zubří bylo v letech 2019 a 2020 hodnoceno 47 položek odrůd a klonů mezirodového křížence ×Festulolium. Výsledkem je sada o počtu 88 SNP markerů, které byly vybrány na základě analýzy referenční populace 47 genotypů ×Festulolium (38 unikátních položek + 9 biologických replik – klonů). Pozice SNP markerů v jednotlivých kontizích referenční sekvence jílku a v uvedených SNP přiléhajících okolních sekvencích je jednoznačně určena. Tato informace slouží pro potřeby návrhu metody detekce těchto SNP markerů a může být využita pro všechny známé technologické postupy detekce markerů typu SNP (např. hybridizačně, enzymaticky, sekvenačně i fyzikálně založené metody detekce SNP).

Název v anglickém jazyce

Association Analysis (GWAS) of ×Festulolium and Identification of SNP Markers for Genomic Selection of Economically Important Traits

Popis výsledku anglicky

Varieties and clones of the interbreed ×Festulolium were subjected to an association analysis (GWAS) to generate a set of associated SNP markers with selected specific agronomically significant traits (drought resistance, leaf width of vegetative shoots, wintering resistance, frost resistance, beginning of peeling, beginning throwing, the shape of the bunch in the vegetative state, resistance to purple mallet, resistance to rust, resistance to endophytic fungi, yield of dry matter) and qualitative features (N-substance content, digestibility of organic matter). In 2019 and 2020, 47 items of varieties and clones of the intergeneric hybrid ×Festulolium were evaluated at the Branch Grass Research Station Rožnov-Zubří. The result is a set of 88 SNP markers, which were selected on the basis of the analysis of the reference population of 47 genotypes ×Festulolium (38 unique items + 9 biological replicas - clones). The position of the SNP markers in the individual contours of the rye reference sequence and in the said SNP-adjacent surrounding sequences is unambiguously determined. This information is used for the design of a method for the detection of these SNP markers and can be used for all known technological procedures for the detection of SNP-type markers (eg hybridization, enzymatically, sequentially and physically based methods of SNP detection).

Druh

J_ost - Ostatní články v recenzovaných periodicích

CEP obor

—

OECD FORD obor

40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Projekt

<a href="/cs/project/TN01000062" target="_blank" >TN01000062: Biotechnologické centrum pro genotypování rostlin</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Úroda

ISSN

0139-6013

e-ISSN

—

Svazek periodika

LXIX

Číslo periodika v rámci svazku

12

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

9

Strana od-do

33-41

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—