Genetické Vyšetření Pomocí Sekvenování Nové Generace U Pacientů S Hypertrofickou Kardiomyopatií

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F27283933%3A_____%2F18%3A00005803" target="_blank" >RIV/27283933:_____/18:00005803 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Genetické Vyšetření Pomocí Sekvenování Nové Generace U Pacientů S Hypertrofickou Kardiomyopatií

Popis výsledku v původním jazyce

Cíl: Hypertrofická kardiomyopatie (HCM) je heterogenní onemocnění z hlediska fenotypu i genetického pozadí. Cílem práce bylo zjistit prevalenci a distribuci genetických mutací na rozsáhlém souboru HCM pacientů z ČR za použití metody sekvenování nové generace (NGS). Soubor a metodika: Do studie jsme zařadili 336 nepříbuzných pacientů (41 % žen, průměrný věk 53 ± 15 let) s klinickou diagnózou HCM. Provedli jsme NGS genomické testování s následnou klasifikací identifikovaných variant podle doporučených postupů American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Výsledky NGS byly korelovány s klinickými a echokardiografickými charakteristikami (věk v době diagnózy, maximální tloušťka stěny levé komory (MLVWT), rodinná anamnéza HCM (FHHCM), rodinná anamnéza náhlé srdeční smrti (FHSCD) a anamnéza arteriální hypertenze (AH). Výsledky: Identifikovali jsme celkem 276 variant v 57 různých genech u 188 (56 %) pacientů s HCM. Sedmdesát dva variant u 71 (21 %) pacientů s HCM bylo dle ACMG guidelines klasifikováno jako patogenní (třída 4 a 5). Mezi pacienty s patogenními mutacemi a ostatními pacienty nebyl pozorován statisticky významný rozdíl v průměrné MLVWT (20.7 ± 4.5 mm vs. 19.6 ± 4.6 mm, p = 0.43), ve výskytu FHHCM (21.1 % vs. 8.3 %, p = 0.92) ani FHSCD (8.5 % vs. 3.8 %, p= 0.99). Byl pozorován statisticky významný rozdíl mezi skupinami pacientů ve věku v době diagnózy (44.5 ± 15.6 let vs. 55.6 ± 13.9 let, p < 0.01) a anamnéze AH (25.3 % vs. 52.1 %, p= 0.03). Závěr: V souboru pacientů s HCM jsme identifikovali pomocí NGS množství genetických variant ve značném počtu genů, s dominantní rolí genu MYBPC3. Relativně málo z nalezených variant bylo klasifikováno jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní. Pacienti s těmito identifikovanými variantami byli významně mladší a měli méně často anamnézu arteriální hypertenze než ostatní HCM pacienti.

Název v anglickém jazyce

Genetic Investigation Using Sequenting a New Generation in Patients with Hypertrophic Cardiomyopathy

Popis výsledku anglicky

Objective: Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is a heterogeneous disease in terms of both phenotype and genetic background. The aim of the work was to determine the prevalence and distribution of genetic mutations in a large group of HCM patients from the Czech Republic using the new generation (NGS) sequencing method. File and Methodology: We included 336 unrelated patients (41% of women, mean age 53 ± 15 years) with clinical diagnosis of HCM. We performed NGS genomic testing followed by classification of identified variants according to the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) recommended procedures. Results of the NGS were correlated with clinical and echocardiographic characteristics (age at diagnosis, maximum left ventricular wall thickness (MLVWT), family history of HCM (FHHCM), family history of sudden cardiac death (FHSCD), and a history of arterial hypertension (AH). Results: We identified a total of 276 variants in 57 different genes in 188 (56%) HCM patients. Seventy-two variants in 71 (21%) HCM patients were classified as pathogenic according to ACMG guidelines (Classes 4 and 5). There was no statistically significant difference in the mean MLVWT (20.7 ± 4.5 mm vs. 19.6 ± 4.6 mm, p = 0.43), FHHCM (21.1% vs. 8.3%, p = 0.92) and FHSCD in patients with pathogenic mutations and other patients (8.5% vs. 3.8%, p = 0.99). A statistically significant difference between age groups at the time of diagnosis (44.5 ± 15.6 years vs 55.6 ± 13.9 years, p <0.01) and a history of AH (25.3% vs. 52.1%, p = 0.03) was observed. Conclusion: In a set of HCM patients, we identified with NGS a number of genetic variants in a large number of genes, with the dominant role of the MYBPC3 gene. Relatively few of the variants found were classified as pathogenic or probably pathogenic. Patients with these identified variants were significantly younger and had less history of arterial hypertension than other HCM patients.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

30201 - Cardiac and Cardiovascular systems

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů