Successor Sequence Predictor (SSP)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F27676013%3A_____%2F24%3AN0000006" target="_blank" >RIV/27676013:_____/24:N0000006 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14310/24:00139869

Výsledek na webu

<a href="https://github.com/loschmidt/successor-sequence-predictor" target="_blank" >https://github.com/loschmidt/successor-sequence-predictor</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Successor Sequence Predictor (SSP)

Popis výsledku v původním jazyce

Successor Sequence Predictor je "in silico" metoda, která napodobuje laboratorní evoluci proteinů tím, že rekonstruuje evoluční historii proteinu a navrhuje budoucí záměny aminokyselin na základě trendů pozorovaných v historii prostřednictvím pečlivě vybraných fyzikálně-chemických deskriptorů. Tento přístup vylepšuje specializované proteiny předpovídáním mutací, které zlepšují požadované vlastnosti, jako je termostabilita, aktivita a rozpustnost. Successor Sequence Predictor lze tedy použít jako obecný nástroj proteinového inženýrství k vývoji prakticky využitelných proteinů. Kód nástroje Successor Sequence Predictor je k dispozici na serveru GitHub https://github.com/loschmidt/successor-sequence-predictor.

Název v anglickém jazyce

Successor Sequence Predictor (SSP)

Popis výsledku anglicky

Successor Sequence Predictor is an in silico method that mimics laboratory-based protein evolution by reconstructing a protein’s evolutionary history and suggesting future amino acid substitutions based on trends observed in that history through carefully selected physicochemical descriptors. This approach enhances specialised proteins by predicting mutations that improve desired properties, such as thermostability, activity, and solubility. Successor Sequence Predictor can thus be used as a general protein engineering tool to develop practically useful proteins. The code of the Successor Sequence Predictor is available on GitHub https://github.com/loschmidt/successor-sequence-predictor.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

<a href="/cs/project/FW03010208" target="_blank" >FW03010208: Stabilizace aplikačně atraktivních FGF proteinů pomocí pokročilých automatizovaných metod proteinového inženýrství</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

FW03010208-V5

Technické parametry

Doposud je využíváno interně oběma subjekty k výzkumným účelům.

Ekonomické parametry

V budoucnu je plánována komerční nabídka potencionálním partnerům z komerční sféry.

IČO vlastníka výsledku

00216224

Název vlastníka

Masarykova univerzita a Enantis (90%:10%)