Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

RNase III-Binding-mRNAs Revealed Novel Complementary Transcripts in Streptomyces

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F44555601%3A13440%2F18%3A43893255" target="_blank" >RIV/44555601:13440/18:43893255 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61388971:_____/18:00488899 RIV/00216208:11110/18:10376322

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2017.02693/full" target="_blank" >https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2017.02693/full</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2017.02693" target="_blank" >10.3389/fmicb.2017.02693</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    RNase III-Binding-mRNAs Revealed Novel Complementary Transcripts in Streptomyces

  • Popis výsledku v původním jazyce

    cis-Antisense RNAs (asRNAs) provide very simple and effective gene expression control due to the perfect complementarity between regulated and regulatory transcripts. In Streptomyces, the antibiotic-producing clade, the antisense control system is not yet understood, although it might direct the organism&apos;s complex development. Initial studies in Streptomyces have found a number of asRNAs. Apart from this, hundreds of mRNAs have been shown to bind RNase III, the double strand-specific endoribonuclease. In this study, we tested 17 mRNAs that have been previously co-precipitated with RNase III for antisense expression. Our RACE mapping showed that all of these mRNAs possess cognate asRNA. Additional tests for antisense expression uncovered as-adpA, as-rnc, as3983, as-sigB, as-sigH, and as-sigR RNAs. Northern blots detected the expression profiles of 18 novel transcripts. Noteworthy, we also found that only a minority of asRNAs respond to the absence of RNase III enzyme by increasing their cellular levels. Our findings suggest that antisense expression is widespread in Streptomyces, including genes of such important developmental regulators, as AdpA, RNase III, and sigma factors.

  • Název v anglickém jazyce

    RNase III-Binding-mRNAs Revealed Novel Complementary Transcripts in Streptomyces

  • Popis výsledku anglicky

    cis-Antisense RNAs (asRNAs) provide very simple and effective gene expression control due to the perfect complementarity between regulated and regulatory transcripts. In Streptomyces, the antibiotic-producing clade, the antisense control system is not yet understood, although it might direct the organism&apos;s complex development. Initial studies in Streptomyces have found a number of asRNAs. Apart from this, hundreds of mRNAs have been shown to bind RNase III, the double strand-specific endoribonuclease. In this study, we tested 17 mRNAs that have been previously co-precipitated with RNase III for antisense expression. Our RACE mapping showed that all of these mRNAs possess cognate asRNA. Additional tests for antisense expression uncovered as-adpA, as-rnc, as3983, as-sigB, as-sigH, and as-sigR RNAs. Northern blots detected the expression profiles of 18 novel transcripts. Noteworthy, we also found that only a minority of asRNAs respond to the absence of RNase III enzyme by increasing their cellular levels. Our findings suggest that antisense expression is widespread in Streptomyces, including genes of such important developmental regulators, as AdpA, RNase III, and sigma factors.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LM2015055" target="_blank" >LM2015055: Centrum pro systémovou biologii</a><br>

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Frontiers in Microbiology

  • ISSN

    1664-302X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    2018

  • Číslo periodika v rámci svazku

    8

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

    "nestrankovano"

  • Kód UT WoS článku

    000419881100006

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85040812843