MemSkel - program pro segmentaci buněčné membrány
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F49777513%3A23520%2F12%3A43918038" target="_blank" >RIV/49777513:23520/12:43918038 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel" target="_blank" >http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
MemSkel - program pro segmentaci buněčné membrány
Popis výsledku v původním jazyce
MemSkel je nástroj pro segmentaci buněčné membrány z mikroskopických snímků. Vstupem programu je mikroskopický snímek získaný horizontální resp. vertikální polarizací. Výstupem programu je binární maska, určující buněčnou membránu a její střednice získaná pomocí metod zpracování obrazu, konkrétně pomocí skeletonizace. Takto získaná střednice je dále aproximována b-splinou, která tvoří druhý výstup programu. Software rovněž podporuje automatické zpracování více-snímkových dat.
Název v anglickém jazyce
MemSkel - software for segmentation of cell membrane
Popis výsledku anglicky
MemSkel is a tool for segmentation of cell membrane from microscopic images. Horizontally or vertically polarized microscopic image is used as an input, the first output is then defined as a binary mask that determines the cell membrane. The second output is medial axis of this binary mask that is acquired by using an image processing method called skeletonization. This medial axis is also approximated with b-spline. Automated processing of multi-frame data images is also supported.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
MemSkel
Technické parametry
Software je používán pro analýzu lineárního dichroismu. Získání licence a/nebo bližších informací: Tomáš Ryba, tryba@kky.zcu.cz, 377632584, http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel
Ekonomické parametry
Využití interaktivity a automatizace poskytované vyvinutým nástrojem slouží k signifikantní úspoře času. Uživatel již nemusí manuálně umisťovat uzly spliny do obrázku (cca 50 uzlů na jeden snímek), v případě více-snímkových dat je časová úspora markantnější. Z Bližší informace: Tomáš Ryba, tryba@kky.zcu.cz, 377632584, http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel .
IČO vlastníka výsledku
49777513
Název vlastníka
Katedra kybernetiky, Fakulta aplikovaných věd, Západočeská univerzita v Plzni