Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

MemSkel - program pro segmentaci buněčné membrány

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F49777513%3A23520%2F12%3A43918038" target="_blank" >RIV/49777513:23520/12:43918038 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel" target="_blank" >http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    čeština

  • Název v původním jazyce

    MemSkel - program pro segmentaci buněčné membrány

  • Popis výsledku v původním jazyce

    MemSkel je nástroj pro segmentaci buněčné membrány z mikroskopických snímků. Vstupem programu je mikroskopický snímek získaný horizontální resp. vertikální polarizací. Výstupem programu je binární maska, určující buněčnou membránu a její střednice získaná pomocí metod zpracování obrazu, konkrétně pomocí skeletonizace. Takto získaná střednice je dále aproximována b-splinou, která tvoří druhý výstup programu. Software rovněž podporuje automatické zpracování více-snímkových dat.

  • Název v anglickém jazyce

    MemSkel - software for segmentation of cell membrane

  • Popis výsledku anglicky

    MemSkel is a tool for segmentation of cell membrane from microscopic images. Horizontally or vertically polarized microscopic image is used as an input, the first output is then defined as a binary mask that determines the cell membrane. The second output is medial axis of this binary mask that is acquired by using an image processing method called skeletonization. This medial axis is also approximated with b-spline. Automated processing of multi-frame data images is also supported.

Klasifikace

  • Druh

    R - Software

  • CEP obor

    JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2012

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Interní identifikační kód produktu

    MemSkel

  • Technické parametry

    Software je používán pro analýzu lineárního dichroismu. Získání licence a/nebo bližších informací: Tomáš Ryba, tryba@kky.zcu.cz, 377632584, http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel

  • Ekonomické parametry

    Využití interaktivity a automatizace poskytované vyvinutým nástrojem slouží k signifikantní úspoře času. Uživatel již nemusí manuálně umisťovat uzly spliny do obrázku (cca 50 uzlů na jeden snímek), v případě více-snímkových dat je časová úspora markantnější. Z Bližší informace: Tomáš Ryba, tryba@kky.zcu.cz, 377632584, http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/memskel .

  • IČO vlastníka výsledku

    49777513

  • Název vlastníka

    Katedra kybernetiky, Fakulta aplikovaných věd, Západočeská univerzita v Plzni