Data analysis for MICA / MICB genes identification

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F49777513%3A23520%2F21%3A43964183" target="_blank" >RIV/49777513:23520/21:43964183 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dspace.zcu.cz" target="_blank" >http://dspace.zcu.cz</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Data analysis for MICA / MICB genes identification

Popis výsledku v původním jazyce

The approach to identifying MICA and MICB alleles is presented. The introduced pipeline contains and compares sequenced data of exons 2-4 of MICA and 2-5 exons of MICB genes obtained from Sanger sequencing together with available reference sequences from IPD database. Specific issues encountered during data processing such as low data quality, sequencing errors, contig creation, or obtaining final result from partial results of mentioned exons. All process was prepared to be proposed as a potential solution for future clinical use.

Název v anglickém jazyce

Data analysis for MICA / MICB genes identification

Popis výsledku anglicky

The approach to identifying MICA and MICB alleles is presented. The introduced pipeline contains and compares sequenced data of exons 2-4 of MICA and 2-5 exons of MICB genes obtained from Sanger sequencing together with available reference sequences from IPD database. Specific issues encountered during data processing such as low data quality, sequencing errors, contig creation, or obtaining final result from partial results of mentioned exons. All process was prepared to be proposed as a potential solution for future clinical use.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

<a href="/cs/project/NV18-03-00277" target="_blank" >NV18-03-00277: Míra polymorfizmů v NK receptorech a jejich ligandech v rámci české populace</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů