Návrh a testování duplex-PCR pro detekci bakteriální skvrnitosti u rajčat
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12220%2F17%3A43896593" target="_blank" >RIV/60076658:12220/17:43896593 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Návrh a testování duplex-PCR pro detekci bakteriální skvrnitosti u rajčat
Popis výsledku v původním jazyce
Předmětem této práce je vývoj metody duplex-PCR pro specifickou detekci fytopatogenních bakterií rodu Xanthomonas, způsobujících bakteriální skvrnitost rajčete. PCR primery pro rozlišení X. euvesicatoria a X. vesicatoria byly navrženy na základě DNA sekvencí bakteriálních kmenů. Navržené primery byly následně důkladně testovány a optimalizovány pro paralelní detekci bakterií. Specificita primerů byla testována na rozsáhlém souboru bakteriálních kmenů patogenních pro rajče a příbuzné plodiny. Dodržením popsaného protokolu lze rychle a spolehlivě identifikovat bakterie X. euvesicatoria a X. vesicatoria v jediné reakci duplex-PCR.
Název v anglickém jazyce
Design and testing of duplex-PCR primers for detection of bacterial spot of tomato
Popis výsledku anglicky
This study presents development of duplex-PCR assay for specific detection of plant pathogenic bacteria of Xanthomonas genus causing bacterial spot of tomato and pepper. PCR primers for differentiation of X. euvesicatoria and X. vesicatoria were developed based on the DNA sequences of bacterial type strains. Primer pairs were designed and subsequently thoroughly tested and optimized for parallel detection of the bacteria. Specificity of the primers was tested on a large complex of bacterial strains pathogenic to tomato, pepper and related crops. Following the described protocol X. euvesicatoria and X. vesicatoria can be quickly and reliably identified in a single duplex-PCR assay.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
—
OECD FORD obor
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2017
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů