Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Parallel adaptation in autopolyploid Arabidopsis arenosa is dominated by repeated recruitment of shared alleles

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12310%2F21%3A43905666" target="_blank" >RIV/60076658:12310/21:43905666 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60077344:_____/21:00547326 RIV/67985939:_____/21:00547326 RIV/00216208:11310/21:10431611

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.nature.com/articles/s41467-021-25256-5" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41467-021-25256-5</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-25256-5" target="_blank" >10.1038/s41467-021-25256-5</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Parallel adaptation in autopolyploid Arabidopsis arenosa is dominated by repeated recruitment of shared alleles

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Relative contributions of pre-existing versus de novo genomic variation to adaptation remain unclear. Here, the authors address this problem by examining the adaptation of autotetraploid Arabidopsis arenosa to serpentine soils and find that both types of variations contribute to rapid adaptation. Relative contributions of pre-existing vs de novo genomic variation to adaptation are poorly understood, especially in polyploid organisms. We assess this in high resolution using autotetraploid Arabidopsis arenosa, which repeatedly adapted to toxic serpentine soils that exhibit skewed elemental profiles. Leveraging a fivefold replicated serpentine invasion, we assess selection on SNPs and structural variants (TEs) in 78 resequenced individuals and discover significant parallelism in candidate genes involved in ion homeostasis. We further model parallel selection and infer repeated sweeps on a shared pool of variants in nearly all these loci, supporting theoretical expectations. A single striking exception is represented by TWO PORE CHANNEL 1, which exhibits convergent evolution from independent de novo mutations at an identical, otherwise conserved site at the calcium channel selectivity gate. Taken together, this suggests that polyploid populations can rapidly adapt to environmental extremes, calling on both pre-existing variation and novel polymorphisms.

  • Název v anglickém jazyce

    Parallel adaptation in autopolyploid Arabidopsis arenosa is dominated by repeated recruitment of shared alleles

  • Popis výsledku anglicky

    Relative contributions of pre-existing versus de novo genomic variation to adaptation remain unclear. Here, the authors address this problem by examining the adaptation of autotetraploid Arabidopsis arenosa to serpentine soils and find that both types of variations contribute to rapid adaptation. Relative contributions of pre-existing vs de novo genomic variation to adaptation are poorly understood, especially in polyploid organisms. We assess this in high resolution using autotetraploid Arabidopsis arenosa, which repeatedly adapted to toxic serpentine soils that exhibit skewed elemental profiles. Leveraging a fivefold replicated serpentine invasion, we assess selection on SNPs and structural variants (TEs) in 78 resequenced individuals and discover significant parallelism in candidate genes involved in ion homeostasis. We further model parallel selection and infer repeated sweeps on a shared pool of variants in nearly all these loci, supporting theoretical expectations. A single striking exception is represented by TWO PORE CHANNEL 1, which exhibits convergent evolution from independent de novo mutations at an identical, otherwise conserved site at the calcium channel selectivity gate. Taken together, this suggests that polyploid populations can rapidly adapt to environmental extremes, calling on both pre-existing variation and novel polymorphisms.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10611 - Plant sciences, botany

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature Communications

  • ISSN

    2041-1723

  • e-ISSN

    2041-1723

  • Svazek periodika

    12

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    nestrankovano

  • Kód UT WoS článku

    000686662300034

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85113557979