Expertomica CellMarker

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12640%2F11%3A43882825" target="_blank" >RIV/60076658:12640/11:43882825 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Expertomica CellMarker

Popis výsledku v původním jazyce

The software was originally developed for manual labeling of cells in series of microscopy images for cell behavior analysis. The software can read the series of images visualize them and allow the user to define the borders of cells. The information about labeled cells is exported into txt file and it can be used for next processing. The software allow the user to do the standard labeling operations (object ID, object replication into next frame, scale definition, etc.). Several advanced functions wereimplemented in the software, for example: automatic adaptation of the shape of labeled cells in next frames, possibility to show different versions of the same image (processed images), export images with labeled cells, contrast enhancement for preciselabeling. The software can be used for semi-automatic labeling of any kind of objects (including sub-objects) in the image series.

Název v anglickém jazyce

Expertomica CellMarker

Popis výsledku anglicky

The software was originally developed for manual labeling of cells in series of microscopy images for cell behavior analysis. The software can read the series of images visualize them and allow the user to define the borders of cells. The information about labeled cells is exported into txt file and it can be used for next processing. The software allow the user to do the standard labeling operations (object ID, object replication into next frame, scale definition, etc.). Several advanced functions wereimplemented in the software, for example: automatic adaptation of the shape of labeled cells in next frames, possibility to show different versions of the same image (processed images), export images with labeled cells, contrast enhancement for preciselabeling. The software can be used for semi-automatic labeling of any kind of objects (including sub-objects) in the image series.

Druh

R - Software

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/ED2.1.00%2F01.0024" target="_blank" >ED2.1.00/01.0024: Jihočeské výzkumné centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Expertomica CellMarker

Technické parametry

Ing. Petr Císař, Ph.D.; Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod, Škola komplexních systémů, Zámek 136, 373 33 Nové Hrady; cisar@frov.jcu.cz

Ekonomické parametry

Úspora člověkohodin práce

IČO vlastníka výsledku

60076658

Název vlastníka

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Ústav fyzikální biologie