Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Izolace a charakterizace vysoce repetitivní frakce genomu banánovníku

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F07%3A00305799" target="_blank" >RIV/60077344:_____/07:00305799 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61389030:_____/07:00305799

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Isolation and characterization of the highly repeated fraction of the banana genome

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Although the nuclear genome of banana (Musa spp.) is relatively small (1C 610 Mbp for M. acuminata ), the results obtained from other sequenced genomes suggest that more than half of the banana genome may be composed of repetitive and non-coding DNA sequences. Knowledge of repetitive DNA can facilitate mapping of important traits, phylogenetic studies, BAC-based physical mapping, and genome sequencing/annotation. However, only a few repetitive DNA sequences have been characterized in banana. In this work, we used DNA reassociation kinetics to isolate the highly repeated fraction of the banana genome (M. acuminata Calcutta 4?). Two libraries, one prepared from Cot < 0.05 DNA (2,688 clones) and one from Cot < 0.1 sequences (4,608 clones), were constructed, and 614 DNA clones were chosen randomly for sequencing and further characterization. Dot-plot analysis revealed that 14% of the sequenced clones contained various semi-tandem and palindromic repeated sequences. BLAST? homology searches

  • Název v anglickém jazyce

    Isolation and characterization of the highly repeated fraction of the banana genome

  • Popis výsledku anglicky

    Although the nuclear genome of banana (Musa spp.) is relatively small (1C 610 Mbp for M. acuminata ), the results obtained from other sequenced genomes suggest that more than half of the banana genome may be composed of repetitive and non-coding DNA sequences. Knowledge of repetitive DNA can facilitate mapping of important traits, phylogenetic studies, BAC-based physical mapping, and genome sequencing/annotation. However, only a few repetitive DNA sequences have been characterized in banana. In this work, we used DNA reassociation kinetics to isolate the highly repeated fraction of the banana genome (M. acuminata Calcutta 4?). Two libraries, one prepared from Cot < 0.05 DNA (2,688 clones) and one from Cot < 0.1 sequences (4,608 clones), were constructed, and 614 DNA clones were chosen randomly for sequencing and further characterization. Dot-plot analysis revealed that 14% of the sequenced clones contained various semi-tandem and palindromic repeated sequences. BLAST? homology searches

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2007

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Cytogenetics and Genome Research

  • ISSN

    1424-8581

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    119

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3-4

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    7

  • Strana od-do

    268-274

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus