Ubiquity of Polynucleobacter necessarius subspecies asymbioticus results from ecological diversification
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F11%3A00358982" target="_blank" >RIV/60077344:_____/11:00358982 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1111/j.1462-2920.2010.02396.x" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1111/j.1462-2920.2010.02396.x</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1111/j.1462-2920.2010.02396.x" target="_blank" >10.1111/j.1462-2920.2010.02396.x</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Ubiquity of Polynucleobacter necessarius subspecies asymbioticus results from ecological diversification
Popis výsledku v původním jazyce
The subspecies Polynucleobacter necessarius asymbioticus (> 99% 16S rRNA similarity) has a cosmopolitan distribution and a ubiquitous occurrence in freshwater habitats. We tested if the observed ubiquity of these free-living planktonic freshwater bacteria results from a euryoecious (generalist) adaptation of P. n. asymbioticus strains, or from ecological diversification within the subspecies. We developed a reverse line blot hybridization assay enabling the cultivation-independent detection of 13 groupswithin the subspecies in environmental samples. A set of 121 lentic freshwater habitats, spanning a broad variety of habitat types (e.g. pH levels ranging from 3.8 to 8.5) was investigated for the presence of these 13 P. n. asymbioticus groups. Statistical analyses of the RLBH detections revealed pronounced differences in habitat preferences of several of the groups. Their preferences differed regarding pH, conductivity, dissolved organic carbon and oxygen concentration of habitats.
Název v anglickém jazyce
Ubiquity of Polynucleobacter necessarius subspecies asymbioticus results from ecological diversification
Popis výsledku anglicky
The subspecies Polynucleobacter necessarius asymbioticus (> 99% 16S rRNA similarity) has a cosmopolitan distribution and a ubiquitous occurrence in freshwater habitats. We tested if the observed ubiquity of these free-living planktonic freshwater bacteria results from a euryoecious (generalist) adaptation of P. n. asymbioticus strains, or from ecological diversification within the subspecies. We developed a reverse line blot hybridization assay enabling the cultivation-independent detection of 13 groupswithin the subspecies in environmental samples. A set of 121 lentic freshwater habitats, spanning a broad variety of habitat types (e.g. pH levels ranging from 3.8 to 8.5) was investigated for the presence of these 13 P. n. asymbioticus groups. Statistical analyses of the RLBH detections revealed pronounced differences in habitat preferences of several of the groups. Their preferences differed regarding pH, conductivity, dissolved organic carbon and oxygen concentration of habitats.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Environmental Microbiology
ISSN
1462-2912
e-ISSN
—
Svazek periodika
13
Číslo periodika v rámci svazku
4
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
922-931
Kód UT WoS článku
000289116700008
EID výsledku v databázi Scopus
—