Next generation sequencing reveals genome downsizing in allotetraploid Nicotiana tabacum, predominantly through the elimination of paternally derived repetitive DNAs

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F11%3A00370331" target="_blank" >RIV/60077344:_____/11:00370331 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68081707:_____/11:00370331
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/molbev/msr112" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/molbev/msr112</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/molbev/msr112" target="_blank" >10.1093/molbev/msr112</a>

Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Next generation sequencing reveals genome downsizing in allotetraploid Nicotiana tabacum, predominantly through the elimination of paternally derived repetitive DNAs
Popis výsledku v původním jazyce
In this work we applied next generation 454 sequencing to analyse genomes of Nicotiana tabacum (tobacco) allotetraploid and its progenitors N. sylvestris and N. tomentosiformis. Using bioinformatic similarity searches we show that the maternal N. sylvestris genome is relatively stable in the tobacco while the paternally derived N. tomentosiformis genome suffered from megased elimination of repeated DNA.
Název v anglickém jazyce
Next generation sequencing reveals genome downsizing in allotetraploid Nicotiana tabacum, predominantly through the elimination of paternally derived repetitive DNAs
Popis výsledku anglicky
In this work we applied next generation 454 sequencing to analyse genomes of Nicotiana tabacum (tobacco) allotetraploid and its progenitors N. sylvestris and N. tomentosiformis. Using bioinformatic similarity searches we show that the maternal N. sylvestris genome is relatively stable in the tobacco while the paternally derived N. tomentosiformis genome suffered from megased elimination of repeated DNA.

Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—

Projekt
<a href="/cs/project/OC10037" target="_blank" >OC10037: Výzkum repetitivní DNA rostlin pomocí bioinformatické analýzy dat z nové generace sekvenačních technologií</a><br>
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika
Molecular Biology and Evolution
ISSN
0737-4038
e-ISSN
—
Svazek periodika
28
Číslo periodika v rámci svazku
10
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
12
Strana od-do
2843-2854
Kód UT WoS článku
000295184200013
EID výsledku v databázi Scopus
—

Podobné výsledky(10)