Next-Generation Sequencing Reveals the Impact of Repetitive DNA Across Phylogenetically Closely Related Genomes of Orobanchaceae
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F12%3A00381629" target="_blank" >RIV/60077344:_____/12:00381629 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/molbev/mss168" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/molbev/mss168</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/molbev/mss168" target="_blank" >10.1093/molbev/mss168</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Next-Generation Sequencing Reveals the Impact of Repetitive DNA Across Phylogenetically Closely Related Genomes of Orobanchaceae
Popis výsledku v původním jazyce
We used next-generation sequencing to characterize the genomes of nine species of Orobanchaceae of known phylogenetic relationships, different life forms, and including a polyploid species. The study species are the autotrophic, nonparasitic Lindenbergiaphilippensis, the hemiparasitic Schwalbea americana, and seven nonphotosynthetic parasitic species of Orobanche (Orobanche crenata, Orobanche cumana, Orobanche gracilis (tetraploid), and Orobanche pancicii) and Phelipanche (Phelipanche lavandulacea, Phelipanche purpurea, and Phelipanche ramosa). Ty3/Gypsy elements comprise 1.93%-28.34% of the nine genomes and Ty1/Copia elements comprise 8.09%-22.83%. When compared with L. philippensis and S. americana, the nonphotosynthetic species contain higher proportions of repetitive DNA sequences, perhaps reflecting relaxed selection on genome size in parasitic organisms.
Název v anglickém jazyce
Next-Generation Sequencing Reveals the Impact of Repetitive DNA Across Phylogenetically Closely Related Genomes of Orobanchaceae
Popis výsledku anglicky
We used next-generation sequencing to characterize the genomes of nine species of Orobanchaceae of known phylogenetic relationships, different life forms, and including a polyploid species. The study species are the autotrophic, nonparasitic Lindenbergiaphilippensis, the hemiparasitic Schwalbea americana, and seven nonphotosynthetic parasitic species of Orobanche (Orobanche crenata, Orobanche cumana, Orobanche gracilis (tetraploid), and Orobanche pancicii) and Phelipanche (Phelipanche lavandulacea, Phelipanche purpurea, and Phelipanche ramosa). Ty3/Gypsy elements comprise 1.93%-28.34% of the nine genomes and Ty1/Copia elements comprise 8.09%-22.83%. When compared with L. philippensis and S. americana, the nonphotosynthetic species contain higher proportions of repetitive DNA sequences, perhaps reflecting relaxed selection on genome size in parasitic organisms.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Molecular Biology and Evolution
ISSN
0737-4038
e-ISSN
—
Svazek periodika
29
Číslo periodika v rámci svazku
11
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
3601-3611
Kód UT WoS článku
000310167700030
EID výsledku v databázi Scopus
—