Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Patterns of Limnohabitans microdiversity across a large set of freshwater habitats as revealed by reverse line blot hybridization

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F13%3A00392317" target="_blank" >RIV/60077344:_____/13:00392317 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0058527" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0058527</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0058527" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0058527</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Patterns of Limnohabitans microdiversity across a large set of freshwater habitats as revealed by reverse line blot hybridization

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Among abundant freshwater Betaproteobacteria, only few groups are considered to be of central ecological importance. One of them is the well-studied genus Limnohabitans and mainly its R-BT subcluster, investigated previously mainly by fluorescence in situ hybridization methods. We designed, based on sequences from a large Limnohabitans culture collection, 18 RLBH (Reverse Line Blot Hybridization) probes specific for different groups within the genus Limnohabitans by targeting diagnostic sequences on their 16 S-23 S rRNA ITS regions. The developed probes covered in sum 92% of the available isolates. This set of probes was applied to environmental DNA originating from 161 different European standing freshwater habitats to reveal the microdiversity (intra-genus) patterns of the Limnohabitans genus along a pH gradient. Habitats differed in various physicochemical parameters, and represented a very broad range of standing freshwater habitats. The Limnohabitans microdiversity, assessed as nu

  • Název v anglickém jazyce

    Patterns of Limnohabitans microdiversity across a large set of freshwater habitats as revealed by reverse line blot hybridization

  • Popis výsledku anglicky

    Among abundant freshwater Betaproteobacteria, only few groups are considered to be of central ecological importance. One of them is the well-studied genus Limnohabitans and mainly its R-BT subcluster, investigated previously mainly by fluorescence in situ hybridization methods. We designed, based on sequences from a large Limnohabitans culture collection, 18 RLBH (Reverse Line Blot Hybridization) probes specific for different groups within the genus Limnohabitans by targeting diagnostic sequences on their 16 S-23 S rRNA ITS regions. The developed probes covered in sum 92% of the available isolates. This set of probes was applied to environmental DNA originating from 161 different European standing freshwater habitats to reveal the microdiversity (intra-genus) patterns of the Limnohabitans genus along a pH gradient. Habitats differed in various physicochemical parameters, and represented a very broad range of standing freshwater habitats. The Limnohabitans microdiversity, assessed as nu

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    DA - Hydrologie a limnologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2013

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLoS ONE

  • ISSN

    1932-6203

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    8

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000316252500028

  • EID výsledku v databázi Scopus