Reflects the coat protein variability of apple mosaic virus host preference?
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F13%3A00397847" target="_blank" >RIV/60077344:_____/13:00397847 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60460709:41210/13:60668
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s11262-013-0925-z" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/s11262-013-0925-z</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s11262-013-0925-z" target="_blank" >10.1007/s11262-013-0925-z</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Reflects the coat protein variability of apple mosaic virus host preference?
Popis výsledku v původním jazyce
Apple mosaic virus (ApMV) is a widespread ssRNA virus which infects diverse species ofRosales. The phylogenetic analysis of complete capsid protein gene of the largest set of ApMV isolates discriminated two main clusters of isolates: one cluster correlates withMaloideae hosts andTrebouxialichen algae hosts; a second with hop, Prunus, and other woody tree hosts. No correlation was found between clusters and geographic origin of virus isolates, and positive selection hypothesis in distinct hosts was not confirmed: in all virus populations, purifying selection had occurred. GGT?AAT substitution resulted in Gly-Asn change inside the zinc-finger motif in the capsid protein was revealed specific for discrimination of the clusters and we hypothesise that could influence the host preference.
Název v anglickém jazyce
Reflects the coat protein variability of apple mosaic virus host preference?
Popis výsledku anglicky
Apple mosaic virus (ApMV) is a widespread ssRNA virus which infects diverse species ofRosales. The phylogenetic analysis of complete capsid protein gene of the largest set of ApMV isolates discriminated two main clusters of isolates: one cluster correlates withMaloideae hosts andTrebouxialichen algae hosts; a second with hop, Prunus, and other woody tree hosts. No correlation was found between clusters and geographic origin of virus isolates, and positive selection hypothesis in distinct hosts was not confirmed: in all virus populations, purifying selection had occurred. GGT?AAT substitution resulted in Gly-Asn change inside the zinc-finger motif in the capsid protein was revealed specific for discrimination of the clusters and we hypothesise that could influence the host preference.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Virus Genes
ISSN
0920-8569
e-ISSN
—
Svazek periodika
47
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
119-125
Kód UT WoS článku
000322874900015
EID výsledku v databázi Scopus
—