Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Genome and Phylogenetic Analyses of Trypanosoma evansi Reveal Extensive Similarity to T. brucei and Multiple Independent Origins for Dyskinetoplasty

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F15%3A00447683" target="_blank" >RIV/60077344:_____/15:00447683 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60076658:12310/15:43888955

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0003404" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0003404</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0003404" target="_blank" >10.1371/journal.pntd.0003404</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Genome and Phylogenetic Analyses of Trypanosoma evansi Reveal Extensive Similarity to T. brucei and Multiple Independent Origins for Dyskinetoplasty

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Two key biological features distinguish Trypanosoma evansi from the T. brucei group: independence from the tsetse fly as obligatory vector, and independence from the need for functional mitochondrial DNA (kinetoplast or kDNA). In an effort to better understand the molecular causes and consequences of these differences, we sequenced the genome of an akinetoplastic T. evansi strain from China and compared it to the T. b. brucei reference strain. The annotated T. evansi genome shows extensive similarity tothe reference, with 94.9% of the predicted T. b. brucei coding sequences (CDS) having an ortholog in T. evansi, and 94.6% of the non-repetitive orthologs having a nucleotide identity of 95% or greater. Interestingly, several procyclin-associated genes (PAGs) were disrupted or not found in this T. evansi strain, suggesting a selective loss of function in the absence of the insect life-cycle stage. Surprisingly, orthologous sequences were found in T. evansi for all 978 nuclear CDS predict

  • Název v anglickém jazyce

    Genome and Phylogenetic Analyses of Trypanosoma evansi Reveal Extensive Similarity to T. brucei and Multiple Independent Origins for Dyskinetoplasty

  • Popis výsledku anglicky

    Two key biological features distinguish Trypanosoma evansi from the T. brucei group: independence from the tsetse fly as obligatory vector, and independence from the need for functional mitochondrial DNA (kinetoplast or kDNA). In an effort to better understand the molecular causes and consequences of these differences, we sequenced the genome of an akinetoplastic T. evansi strain from China and compared it to the T. b. brucei reference strain. The annotated T. evansi genome shows extensive similarity tothe reference, with 94.9% of the predicted T. b. brucei coding sequences (CDS) having an ortholog in T. evansi, and 94.6% of the non-repetitive orthologs having a nucleotide identity of 95% or greater. Interestingly, several procyclin-associated genes (PAGs) were disrupted or not found in this T. evansi strain, suggesting a selective loss of function in the absence of the insect life-cycle stage. Surprisingly, orthologous sequences were found in T. evansi for all 978 nuclear CDS predict

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EE2.3.30.0032" target="_blank" >EE2.3.30.0032: Vytvoření postdoktorandských pozic na Biologickém centru AV ČR k rozvoji biologických disciplín a dosažení globální konkurenceschopnosti</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLoS Neglected Tropical Diseases

  • ISSN

    1935-2735

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    21

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000349318100020

  • EID výsledku v databázi Scopus