Genome and Phylogenetic Analyses of Trypanosoma evansi Reveal Extensive Similarity to T. brucei and Multiple Independent Origins for Dyskinetoplasty
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F15%3A00447683" target="_blank" >RIV/60077344:_____/15:00447683 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60076658:12310/15:43888955
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0003404" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0003404</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0003404" target="_blank" >10.1371/journal.pntd.0003404</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Genome and Phylogenetic Analyses of Trypanosoma evansi Reveal Extensive Similarity to T. brucei and Multiple Independent Origins for Dyskinetoplasty
Popis výsledku v původním jazyce
Two key biological features distinguish Trypanosoma evansi from the T. brucei group: independence from the tsetse fly as obligatory vector, and independence from the need for functional mitochondrial DNA (kinetoplast or kDNA). In an effort to better understand the molecular causes and consequences of these differences, we sequenced the genome of an akinetoplastic T. evansi strain from China and compared it to the T. b. brucei reference strain. The annotated T. evansi genome shows extensive similarity tothe reference, with 94.9% of the predicted T. b. brucei coding sequences (CDS) having an ortholog in T. evansi, and 94.6% of the non-repetitive orthologs having a nucleotide identity of 95% or greater. Interestingly, several procyclin-associated genes (PAGs) were disrupted or not found in this T. evansi strain, suggesting a selective loss of function in the absence of the insect life-cycle stage. Surprisingly, orthologous sequences were found in T. evansi for all 978 nuclear CDS predict
Název v anglickém jazyce
Genome and Phylogenetic Analyses of Trypanosoma evansi Reveal Extensive Similarity to T. brucei and Multiple Independent Origins for Dyskinetoplasty
Popis výsledku anglicky
Two key biological features distinguish Trypanosoma evansi from the T. brucei group: independence from the tsetse fly as obligatory vector, and independence from the need for functional mitochondrial DNA (kinetoplast or kDNA). In an effort to better understand the molecular causes and consequences of these differences, we sequenced the genome of an akinetoplastic T. evansi strain from China and compared it to the T. b. brucei reference strain. The annotated T. evansi genome shows extensive similarity tothe reference, with 94.9% of the predicted T. b. brucei coding sequences (CDS) having an ortholog in T. evansi, and 94.6% of the non-repetitive orthologs having a nucleotide identity of 95% or greater. Interestingly, several procyclin-associated genes (PAGs) were disrupted or not found in this T. evansi strain, suggesting a selective loss of function in the absence of the insect life-cycle stage. Surprisingly, orthologous sequences were found in T. evansi for all 978 nuclear CDS predict
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/EE2.3.30.0032" target="_blank" >EE2.3.30.0032: Vytvoření postdoktorandských pozic na Biologickém centru AV ČR k rozvoji biologických disciplín a dosažení globální konkurenceschopnosti</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
PLoS Neglected Tropical Diseases
ISSN
1935-2735
e-ISSN
—
Svazek periodika
9
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
21
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000349318100020
EID výsledku v databázi Scopus
—