Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Evolution of cyclizing 5-aminolevulinate synthases in the biosynthesis of actinomycete secondary metabolites: outcomes for genetic screening techniques

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F15%3A00448715" target="_blank" >RIV/60077344:_____/15:00448715 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61388971:_____/15:00448715

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00814" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00814</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00814" target="_blank" >10.3389/fmicb.2015.00814</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Evolution of cyclizing 5-aminolevulinate synthases in the biosynthesis of actinomycete secondary metabolites: outcomes for genetic screening techniques

  • Popis výsledku v původním jazyce

    A combined approach, comprising PCR screening and genome mining, was used to unravel the diversity and phylogeny of genes encoding 5-aminolevulinic acid synthases (ALASs, hemA gene products) in streptomycetes-related strains. In actinomycetes, these genes were believed to be directly connected with the production of secondary metabolites carrying the C5N unit, 2-amino-3-hydroxycyclopent-2-enone, with biological activities making them attractive for future use in medicine and agriculture. Unlike "classical" primary metabolism ALAS, the C5N unit-forming cyclizing ALAS (cALAS) catalyses intramolecular cyclization of nascent 5-aminolevulinate. Specific amino acid sequence changes can be traced by comparison of "classical" ALASs against cALASs. PCR screening revealed 226 hemA gene-carrying strains from 1,500 tested, with 87% putatively encoding cALAS. Phylogenetic analysis of the hemA homologs revealed strain clustering according to putative type of metabolic product, which could be used to

  • Název v anglickém jazyce

    Evolution of cyclizing 5-aminolevulinate synthases in the biosynthesis of actinomycete secondary metabolites: outcomes for genetic screening techniques

  • Popis výsledku anglicky

    A combined approach, comprising PCR screening and genome mining, was used to unravel the diversity and phylogeny of genes encoding 5-aminolevulinic acid synthases (ALASs, hemA gene products) in streptomycetes-related strains. In actinomycetes, these genes were believed to be directly connected with the production of secondary metabolites carrying the C5N unit, 2-amino-3-hydroxycyclopent-2-enone, with biological activities making them attractive for future use in medicine and agriculture. Unlike "classical" primary metabolism ALAS, the C5N unit-forming cyclizing ALAS (cALAS) catalyses intramolecular cyclization of nascent 5-aminolevulinate. Specific amino acid sequence changes can be traced by comparison of "classical" ALASs against cALASs. PCR screening revealed 226 hemA gene-carrying strains from 1,500 tested, with 87% putatively encoding cALAS. Phylogenetic analysis of the hemA homologs revealed strain clustering according to putative type of metabolic product, which could be used to

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EE - Mikrobiologie, virologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LH12191" target="_blank" >LH12191: Nové manumyciny cestami specifického genetického screeningu přírodních izolátů streptomycet a kombinatorní biosyntézy</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Frontiers in Microbiology

  • ISSN

    1664-302X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    6

  • Číslo periodika v rámci svazku

    AUG 2015

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000359485700002

  • EID výsledku v databázi Scopus