Evolution of cyclizing 5-aminolevulinate synthases in the biosynthesis of actinomycete secondary metabolites: outcomes for genetic screening techniques
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F15%3A00448715" target="_blank" >RIV/60077344:_____/15:00448715 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388971:_____/15:00448715
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00814" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00814</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00814" target="_blank" >10.3389/fmicb.2015.00814</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Evolution of cyclizing 5-aminolevulinate synthases in the biosynthesis of actinomycete secondary metabolites: outcomes for genetic screening techniques
Popis výsledku v původním jazyce
A combined approach, comprising PCR screening and genome mining, was used to unravel the diversity and phylogeny of genes encoding 5-aminolevulinic acid synthases (ALASs, hemA gene products) in streptomycetes-related strains. In actinomycetes, these genes were believed to be directly connected with the production of secondary metabolites carrying the C5N unit, 2-amino-3-hydroxycyclopent-2-enone, with biological activities making them attractive for future use in medicine and agriculture. Unlike "classical" primary metabolism ALAS, the C5N unit-forming cyclizing ALAS (cALAS) catalyses intramolecular cyclization of nascent 5-aminolevulinate. Specific amino acid sequence changes can be traced by comparison of "classical" ALASs against cALASs. PCR screening revealed 226 hemA gene-carrying strains from 1,500 tested, with 87% putatively encoding cALAS. Phylogenetic analysis of the hemA homologs revealed strain clustering according to putative type of metabolic product, which could be used to
Název v anglickém jazyce
Evolution of cyclizing 5-aminolevulinate synthases in the biosynthesis of actinomycete secondary metabolites: outcomes for genetic screening techniques
Popis výsledku anglicky
A combined approach, comprising PCR screening and genome mining, was used to unravel the diversity and phylogeny of genes encoding 5-aminolevulinic acid synthases (ALASs, hemA gene products) in streptomycetes-related strains. In actinomycetes, these genes were believed to be directly connected with the production of secondary metabolites carrying the C5N unit, 2-amino-3-hydroxycyclopent-2-enone, with biological activities making them attractive for future use in medicine and agriculture. Unlike "classical" primary metabolism ALAS, the C5N unit-forming cyclizing ALAS (cALAS) catalyses intramolecular cyclization of nascent 5-aminolevulinate. Specific amino acid sequence changes can be traced by comparison of "classical" ALASs against cALASs. PCR screening revealed 226 hemA gene-carrying strains from 1,500 tested, with 87% putatively encoding cALAS. Phylogenetic analysis of the hemA homologs revealed strain clustering according to putative type of metabolic product, which could be used to
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/LH12191" target="_blank" >LH12191: Nové manumyciny cestami specifického genetického screeningu přírodních izolátů streptomycet a kombinatorní biosyntézy</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Frontiers in Microbiology
ISSN
1664-302X
e-ISSN
—
Svazek periodika
6
Číslo periodika v rámci svazku
AUG 2015
Stát vydavatele periodika
CH - Švýcarská konfederace
Počet stran výsledku
15
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000359485700002
EID výsledku v databázi Scopus
—