Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Employing next generation sequencing to explore the repeat landscape of the plant genome

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F15%3A00456622" target="_blank" >RIV/60077344:_____/15:00456622 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Employing next generation sequencing to explore the repeat landscape of the plant genome

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Plant genomes are dominated by repetitive DNA sequences of many distinct types which, due to their variability and high copy numbers, are difficult to analyse. This sequence complexity has recently become accessible to detailed investigations with the advent of next-generation sequencing technologies and novel analytical approaches utilizing low-pass genome sequence data. Here we explore the insights these methods have provided to our understanding of plant genomes, and review bioinformatic tools used in their analyses. We show that the repeats are diverse and fast diverging even between closely related lineages. We explore how the method has been used to study repeats in large and small plant genomes, and in association with polyploidy, distinctive chromosomes (sex chromosomes, B chromosomes, holocentric chromosomes), chromosome domains (e.g., rDNA loci and centromeres) and species groups of interest.

  • Název v anglickém jazyce

    Employing next generation sequencing to explore the repeat landscape of the plant genome

  • Popis výsledku anglicky

    Plant genomes are dominated by repetitive DNA sequences of many distinct types which, due to their variability and high copy numbers, are difficult to analyse. This sequence complexity has recently become accessible to detailed investigations with the advent of next-generation sequencing technologies and novel analytical approaches utilizing low-pass genome sequence data. Here we explore the insights these methods have provided to our understanding of plant genomes, and review bioinformatic tools used in their analyses. We show that the repeats are diverse and fast diverging even between closely related lineages. We explore how the method has been used to study repeats in large and small plant genomes, and in association with polyploidy, distinctive chromosomes (sex chromosomes, B chromosomes, holocentric chromosomes), chromosome domains (e.g., rDNA loci and centromeres) and species groups of interest.

Klasifikace

  • Druh

    O - Ostatní výsledky

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GBP501%2F12%2FG090" target="_blank" >GBP501/12/G090: Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů