´Candidatus Phytoplasma asteris´and ´Candidatus Phytoplasma mali´ strains infecting sweet and sour cherry in the Czech Republic
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F18%3A00495075" target="_blank" >RIV/60077344:_____/18:00495075 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1111/jph.12661" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1111/jph.12661</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1111/jph.12661" target="_blank" >10.1111/jph.12661</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
´Candidatus Phytoplasma asteris´and ´Candidatus Phytoplasma mali´ strains infecting sweet and sour cherry in the Czech Republic
Popis výsledku v původním jazyce
A survey for phytoplasma diseases was conducted in a sweet and sour cherry germplasm collection and in cherry orchards within the Czech Republic during 2014-2015. Phytoplasmas were detected in 21 symptomatic trees. Multiple infections of cherry trees by diverse phytoplasmas of 16SrI and 16SrX groups and 16SrI-A, 16SrI-B, 16SrI-L, 16SrX-A subgroups were detected by restriction fragment length polymorphism (RFLP). Nevertheless, phylogenetic analysis placed subgroups 16SrI-B and 16SrI-L inseparable together onto one branch of phylogenetic tree. This is the first report of subgroups 16SrI-A and 16SrI-L in Prunus spp., and subgroup 16SrX-A in sour cherry trees. Additionally, novel RFLP profiles for 16SrI-A and 16SrI-B-related phytoplasmas were found in cherry samples. Phytoplasmas with these novel profiles belong, however, to their respective 16SrI-A or 16SrI-B phylogenetic clades.
Název v anglickém jazyce
´Candidatus Phytoplasma asteris´and ´Candidatus Phytoplasma mali´ strains infecting sweet and sour cherry in the Czech Republic
Popis výsledku anglicky
A survey for phytoplasma diseases was conducted in a sweet and sour cherry germplasm collection and in cherry orchards within the Czech Republic during 2014-2015. Phytoplasmas were detected in 21 symptomatic trees. Multiple infections of cherry trees by diverse phytoplasmas of 16SrI and 16SrX groups and 16SrI-A, 16SrI-B, 16SrI-L, 16SrX-A subgroups were detected by restriction fragment length polymorphism (RFLP). Nevertheless, phylogenetic analysis placed subgroups 16SrI-B and 16SrI-L inseparable together onto one branch of phylogenetic tree. This is the first report of subgroups 16SrI-A and 16SrI-L in Prunus spp., and subgroup 16SrX-A in sour cherry trees. Additionally, novel RFLP profiles for 16SrI-A and 16SrI-B-related phytoplasmas were found in cherry samples. Phytoplasmas with these novel profiles belong, however, to their respective 16SrI-A or 16SrI-B phylogenetic clades.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10611 - Plant sciences, botany
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/LD14004" target="_blank" >LD14004: Analýza viromu třešní a višní sekvenováním nové generace a vývoj nástrojů pro specifickou detekci virů PCR.</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2018
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Phytopathology - Phytopathologische Zeitschrift
ISSN
0931-1785
e-ISSN
—
Svazek periodika
166
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
DE - Spolková republika Německo
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
59-66
Kód UT WoS článku
000417767700008
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85037703370