Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Phylogenomic Analysis of Nassula variabilis n. sp., Furgasonia blochmanni, and Pseudomicrothorax dubius Confirms a Nassophorean Clade

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F18%3A00498754" target="_blank" >RIV/60077344:_____/18:00498754 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.protis.2018.02.002" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.protis.2018.02.002</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.protis.2018.02.002" target="_blank" >10.1016/j.protis.2018.02.002</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Phylogenomic Analysis of Nassula variabilis n. sp., Furgasonia blochmanni, and Pseudomicrothorax dubius Confirms a Nassophorean Clade

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The class Nassophorea includes the microthoracids and nassulids, which share morphological similarities in their somatic kinetids and cytopharyngeal baskets. The monophyly of this clade has been challenged by small subunit rRNA gene sequences and multi-gene analyses that do not provide strong support. To provide a more robust test of the monophyly of the Nassophorea, phylogenomic analyses were based on 124 genes derived from the single-cell transcriptomes of the microthoracid Pseudomicrothorax dubius and the nassulid Furgasonia blochmanni. The nassulid Nassula sorex from the Culture Centre for Algae and Protozoa was also included, but this isolate was discovered to have been misidentified. We first redescribe, using light and scanning electron microscopical techniques, this “N. sorex” as a new species of Nassula, Nassula variabilis n. sp., characterized by its highly variable nassulid frange. We have sequenced the single-cell transcriptomes to obtain data for phylogenomic analyses. These gave robust support for the Nassophorea, which are sister to a clade of Colpodea species. If our topology truly represents the order of divergence of taxa, a cytopharyngeal basket with microtubular nematodesmata and with Y and Z microtubular ribbons was likely an ancestral feature, at least of the Phyllopharyngea, Colpodea, Nassophorea, and Oligohymenophorea.

  • Název v anglickém jazyce

    Phylogenomic Analysis of Nassula variabilis n. sp., Furgasonia blochmanni, and Pseudomicrothorax dubius Confirms a Nassophorean Clade

  • Popis výsledku anglicky

    The class Nassophorea includes the microthoracids and nassulids, which share morphological similarities in their somatic kinetids and cytopharyngeal baskets. The monophyly of this clade has been challenged by small subunit rRNA gene sequences and multi-gene analyses that do not provide strong support. To provide a more robust test of the monophyly of the Nassophorea, phylogenomic analyses were based on 124 genes derived from the single-cell transcriptomes of the microthoracid Pseudomicrothorax dubius and the nassulid Furgasonia blochmanni. The nassulid Nassula sorex from the Culture Centre for Algae and Protozoa was also included, but this isolate was discovered to have been misidentified. We first redescribe, using light and scanning electron microscopical techniques, this “N. sorex” as a new species of Nassula, Nassula variabilis n. sp., characterized by its highly variable nassulid frange. We have sequenced the single-cell transcriptomes to obtain data for phylogenomic analyses. These gave robust support for the Nassophorea, which are sister to a clade of Colpodea species. If our topology truly represents the order of divergence of taxa, a cytopharyngeal basket with microtubular nematodesmata and with Y and Z microtubular ribbons was likely an ancestral feature, at least of the Phyllopharyngea, Colpodea, Nassophorea, and Oligohymenophorea.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_019%2F0000759" target="_blank" >EF16_019/0000759: Centrum výzkumu patogenity a virulence parazitů</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Protist

  • ISSN

    1434-4610

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    169

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    180-189

  • Kód UT WoS článku

    000432462700003

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85044606031