Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Single cell genomics of uncultured marine alveolates shows paraphyly of basal dinoflagellates

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F18%3A00498829" target="_blank" >RIV/60077344:_____/18:00498829 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2017.167" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2017.167</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2017.167" target="_blank" >10.1038/ismej.2017.167</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Single cell genomics of uncultured marine alveolates shows paraphyly of basal dinoflagellates

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Marine alveolates (MALVs) are diverse and widespread early-branching dinoflagellates, but most knowledge of the group comes from a few cultured species that are generally not abundant in natural samples, or from diversity analyses of PCR-based environmental SSU rRNA gene sequences. To more broadly examine MALV genomes, we generated single cell genome sequences from seven individually isolated cells. Genes expected of heterotrophic eukaryotes were found, with interesting exceptions like presence of proteorhodopsin and vacuolar H +-pyrophosphatase. Phylogenetic analysis of concatenated SSU and LSU rRNA gene sequences provided strong support for the paraphyly of MALV lineages. Dinoflagellate viral nucleoproteins were found only in MALV groups that branched as sister to dinokaryotes. Our findings indicate that multiple independent origins of several characteristics early in dinoflagellate evolution, such as a parasitic life style, underlie the environmental diversity of MALVs, and suggest they have more varied trophic modes than previously thought.

  • Název v anglickém jazyce

    Single cell genomics of uncultured marine alveolates shows paraphyly of basal dinoflagellates

  • Popis výsledku anglicky

    Marine alveolates (MALVs) are diverse and widespread early-branching dinoflagellates, but most knowledge of the group comes from a few cultured species that are generally not abundant in natural samples, or from diversity analyses of PCR-based environmental SSU rRNA gene sequences. To more broadly examine MALV genomes, we generated single cell genome sequences from seven individually isolated cells. Genes expected of heterotrophic eukaryotes were found, with interesting exceptions like presence of proteorhodopsin and vacuolar H +-pyrophosphatase. Phylogenetic analysis of concatenated SSU and LSU rRNA gene sequences provided strong support for the paraphyly of MALV lineages. Dinoflagellate viral nucleoproteins were found only in MALV groups that branched as sister to dinokaryotes. Our findings indicate that multiple independent origins of several characteristics early in dinoflagellate evolution, such as a parasitic life style, underlie the environmental diversity of MALVs, and suggest they have more varied trophic modes than previously thought.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    The ISME Journal

  • ISSN

    1751-7362

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    12

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    5

  • Strana od-do

    304-308

  • Kód UT WoS článku

    000418293300026

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85038625576