Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

CRISPR/Cas9 genome editing introduction and optimization in the non-model insect Pyrrhocoris apterus

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F19%3A00506496" target="_blank" >RIV/60077344:_____/19:00506496 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60076658:12310/19:43899510

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fphys.2019.00891/full" target="_blank" >https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fphys.2019.00891/full</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3389/fphys.2019.00891" target="_blank" >10.3389/fphys.2019.00891</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    CRISPR/Cas9 genome editing introduction and optimization in the non-model insect Pyrrhocoris apterus

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The CRISPR/Cas9 technique is widely used in experimentation with human cell lines as well as with other model systems, such as mice Mus musculus, zebrafish Danio reiro, and the fruit fly Drosophila melanogaster. However, publications describing the use of CRISPR/Cas9 for genome editing in non-model organisms, including non-model insects, are scarce. The introduction of this relatively new method presents many problems even for experienced researchers, especially with the lack of procedures to tackle issues concerning the efficiency of mutant generation. Here we present a protocol for efficient genome editing in the non-model insect species Pyrrhocoris apterus. We collected data from several independent trials that targeted several genes using the CRISPR/Cas9 system and determined that several crucial optimization steps led to a remarkably increased efficiency of mutant production. The main steps are as follows: the timing of embryo injection, the use of the heteroduplex mobility assay as a screening method, in vivo testing of sgRNA efficiency, and G0 germline mosaicism screening. The timing and the method of egg injections used here need to be optimized for other species, but other here-described optimization solutions can be applied immediately for genome editing in other insect species.

  • Název v anglickém jazyce

    CRISPR/Cas9 genome editing introduction and optimization in the non-model insect Pyrrhocoris apterus

  • Popis výsledku anglicky

    The CRISPR/Cas9 technique is widely used in experimentation with human cell lines as well as with other model systems, such as mice Mus musculus, zebrafish Danio reiro, and the fruit fly Drosophila melanogaster. However, publications describing the use of CRISPR/Cas9 for genome editing in non-model organisms, including non-model insects, are scarce. The introduction of this relatively new method presents many problems even for experienced researchers, especially with the lack of procedures to tackle issues concerning the efficiency of mutant generation. Here we present a protocol for efficient genome editing in the non-model insect species Pyrrhocoris apterus. We collected data from several independent trials that targeted several genes using the CRISPR/Cas9 system and determined that several crucial optimization steps led to a remarkably increased efficiency of mutant production. The main steps are as follows: the timing of embryo injection, the use of the heteroduplex mobility assay as a screening method, in vivo testing of sgRNA efficiency, and G0 germline mosaicism screening. The timing and the method of egg injections used here need to be optimized for other species, but other here-described optimization solutions can be applied immediately for genome editing in other insect species.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA15-23681S" target="_blank" >GA15-23681S: Neuroendokrinní regulace reprodukční diapauzy a metamorfózy hmyzu</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Frontiers in physiology

  • ISSN

    1664-042X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    10

  • Číslo periodika v rámci svazku

    JUL 15

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

    891

  • Kód UT WoS článku

    000475487600001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85069944729