Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Culturomics-based genomics sheds light on the ecology of the new haloarchaeal genus Halosegnis.

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F21%3A00552524" target="_blank" >RIV/60077344:_____/21:00552524 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1111/1462-2920.15082" target="_blank" >https://doi.org/10.1111/1462-2920.15082</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.15082" target="_blank" >10.1111/1462-2920.15082</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Culturomics-based genomics sheds light on the ecology of the new haloarchaeal genus Halosegnis.

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The development of culture-independent techniques has revolutionized our understanding of microbial ecology, especially through the illustration of the vast gap between the environmentally abundant microbial diversity and that accessible through cultivation. However, culture-based approaches are not only crucial for understanding the evolutionary, metabolic and ecological milieu of microbial diversity but also for the development of novel biotechnological applications. In this study, we used a culturomics-based approach in order to isolate novel microbial taxa from hypersaline environments (i.e. Isla Cristina and Isla Bacuta salterns in Huelva, Spain). We managed to obtain axenic cultures of four haloarchaeal strains that belong to a new haloarchaeal genus and to obtain their genomic sequences. The phylogenomic and phylogenetic analyses (together with AAI, ANI and digital DDH indices) showed that the isolates constitute two new species, for which we propose the names Halosegnis longus sp. nov. and Halosegnis rubeus sp. nov. The genomic-based metabolic reconstructions indicated that members of this new haloarchaeal genus have photoheterotrophic aerobic lifestyle with a typical salt-in signature. 16S rRNA gene sequence reads abundance profiles and genomic recruitment analyses revealed that the Halosegnis genus has a worldwide geographical distribution, reaching high abundance (up to 8%) in habitats with intermediate salinities.

  • Název v anglickém jazyce

    Culturomics-based genomics sheds light on the ecology of the new haloarchaeal genus Halosegnis.

  • Popis výsledku anglicky

    The development of culture-independent techniques has revolutionized our understanding of microbial ecology, especially through the illustration of the vast gap between the environmentally abundant microbial diversity and that accessible through cultivation. However, culture-based approaches are not only crucial for understanding the evolutionary, metabolic and ecological milieu of microbial diversity but also for the development of novel biotechnological applications. In this study, we used a culturomics-based approach in order to isolate novel microbial taxa from hypersaline environments (i.e. Isla Cristina and Isla Bacuta salterns in Huelva, Spain). We managed to obtain axenic cultures of four haloarchaeal strains that belong to a new haloarchaeal genus and to obtain their genomic sequences. The phylogenomic and phylogenetic analyses (together with AAI, ANI and digital DDH indices) showed that the isolates constitute two new species, for which we propose the names Halosegnis longus sp. nov. and Halosegnis rubeus sp. nov. The genomic-based metabolic reconstructions indicated that members of this new haloarchaeal genus have photoheterotrophic aerobic lifestyle with a typical salt-in signature. 16S rRNA gene sequence reads abundance profiles and genomic recruitment analyses revealed that the Halosegnis genus has a worldwide geographical distribution, reaching high abundance (up to 8%) in habitats with intermediate salinities.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Environmental Microbiology

  • ISSN

    1462-2912

  • e-ISSN

    1462-2920

  • Svazek periodika

    23

  • Číslo periodika v rámci svazku

    7

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    17

  • Strana od-do

    3418-3434

  • Kód UT WoS článku

    000540230800001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85086473402