Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Detection of Anaplasma phagocytophilum in European brown hares (Lepus europaeus) using three different methods

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F21%3A00554280" target="_blank" >RIV/60077344:_____/21:00554280 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11140/21:10432880 RIV/60460709:41210/21:88263 RIV/62157124:16170/21:43879116 RIV/62157124:16810/21:43879116 a 2 dalších

  • Výsledek na webu

    <a href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/zph.12883" target="_blank" >https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/zph.12883</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1111/zph.12883" target="_blank" >10.1111/zph.12883</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Detection of Anaplasma phagocytophilum in European brown hares (Lepus europaeus) using three different methods

  • Popis výsledku v původním jazyce

    European brown hare (Lepus europaeus Pallas 1778) is a broadly distributed lagomorph species in Europe, recognized as a host for Ixodes ricinus and reservoir of a wide range of pathogens with zoonotic potential. Even though Lepus europaeus represents an important game animal in Central Europe, the data available on Anaplasma phagocytophilum in this lagomorph are scarce. In this study, three populations of brown hare from distinct localities in the Czech Republic were analysed for the presence of Anaplasma phagocytophilum DNA. We used standard qPCR, targeting the msp2 gene and adapted the same assay also for digital droplet PCR. Out of 91 samples, these two methods identified 9 and 12 as positive, respectively. For taxonomic analysis, we amplified the groEL gene from five of six samples that were found positive by both methods. In phylogenetic analyses, this haplotype belongs to ecotype 1, and to the subclade with isolates from cervids and I. ricinus. Our findings underline the importance of correct result interpretation and positivity cut-off set-up for different detection methods of A. phagocytophilum. This bacterium is characterized by a high intraspecific variability and highly sensitive detection itself, is not enough. Detailed molecular typing is necessary to define the zoonotic potential of different strains and their natural reservoirs.

  • Název v anglickém jazyce

    Detection of Anaplasma phagocytophilum in European brown hares (Lepus europaeus) using three different methods

  • Popis výsledku anglicky

    European brown hare (Lepus europaeus Pallas 1778) is a broadly distributed lagomorph species in Europe, recognized as a host for Ixodes ricinus and reservoir of a wide range of pathogens with zoonotic potential. Even though Lepus europaeus represents an important game animal in Central Europe, the data available on Anaplasma phagocytophilum in this lagomorph are scarce. In this study, three populations of brown hare from distinct localities in the Czech Republic were analysed for the presence of Anaplasma phagocytophilum DNA. We used standard qPCR, targeting the msp2 gene and adapted the same assay also for digital droplet PCR. Out of 91 samples, these two methods identified 9 and 12 as positive, respectively. For taxonomic analysis, we amplified the groEL gene from five of six samples that were found positive by both methods. In phylogenetic analyses, this haplotype belongs to ecotype 1, and to the subclade with isolates from cervids and I. ricinus. Our findings underline the importance of correct result interpretation and positivity cut-off set-up for different detection methods of A. phagocytophilum. This bacterium is characterized by a high intraspecific variability and highly sensitive detection itself, is not enough. Detailed molecular typing is necessary to define the zoonotic potential of different strains and their natural reservoirs.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10613 - Zoology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Zoonoses and Public Health

  • ISSN

    1863-1959

  • e-ISSN

    1863-2378

  • Svazek periodika

    68

  • Číslo periodika v rámci svazku

    8

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    917-925

  • Kód UT WoS článku

    000683888600001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85112245550