Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Using the multi-omics approach to reveal the silk composition in Plectrocnemia conspersa

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F22%3A00559958" target="_blank" >RIV/60077344:_____/22:00559958 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68378050:_____/22:00559958 RIV/60076658:12310/22:43904664 RIV/60460709:41320/22:94267

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmolb.2022.945239/pdf" target="_blank" >https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmolb.2022.945239/pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2022.945239" target="_blank" >10.3389/fmolb.2022.945239</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Using the multi-omics approach to reveal the silk composition in Plectrocnemia conspersa

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Similar to Lepidoptera, the larvae of Trichoptera are also capable of producing silk. Plectrocnemia conspersa, a predatory species belonging to the suborder Annulipalpia, builds massive silken retreats with preycapturing nets. In this study, we describe the silk glands of P. conspersa and use the multi-omics methods to obtain a complete picture of the fiber composition. A combination of silk gland- specific transcriptome and proteomic analyses of the spun-out fibers yielded 27 significant candidates whose full-length sequences and gene structures were retrieved from the publicly available genome database. About one-third of the candidates were completely novel proteins for which there are no described homologs, including a group of five pseudofibroins, proteins with a composition similar to fibroin heavy chain. The rest were homologs of lepidopteran silk proteins, although some had a larger number of paralogs. On the other hand, P. conspersa fibers lacked some proteins that are regular components in moth silk. In summary, the multi-omics approach provides an opportunity to compare the overall composition of silk with other insect species. A sufficient number of such studies will make it possible to distinguish between the basic components of all silks and the proteins that represent the adaptation of the fibers for specific purposes or environments.

  • Název v anglickém jazyce

    Using the multi-omics approach to reveal the silk composition in Plectrocnemia conspersa

  • Popis výsledku anglicky

    Similar to Lepidoptera, the larvae of Trichoptera are also capable of producing silk. Plectrocnemia conspersa, a predatory species belonging to the suborder Annulipalpia, builds massive silken retreats with preycapturing nets. In this study, we describe the silk glands of P. conspersa and use the multi-omics methods to obtain a complete picture of the fiber composition. A combination of silk gland- specific transcriptome and proteomic analyses of the spun-out fibers yielded 27 significant candidates whose full-length sequences and gene structures were retrieved from the publicly available genome database. About one-third of the candidates were completely novel proteins for which there are no described homologs, including a group of five pseudofibroins, proteins with a composition similar to fibroin heavy chain. The rest were homologs of lepidopteran silk proteins, although some had a larger number of paralogs. On the other hand, P. conspersa fibers lacked some proteins that are regular components in moth silk. In summary, the multi-omics approach provides an opportunity to compare the overall composition of silk with other insect species. A sufficient number of such studies will make it possible to distinguish between the basic components of all silks and the proteins that represent the adaptation of the fibers for specific purposes or environments.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10605 - Developmental biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Frontiers in molecular biosciences

  • ISSN

    2296-889X

  • e-ISSN

    2296-889X

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    AUG 11

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    14

  • Strana od-do

    945239

  • Kód UT WoS článku

    000848541300001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85137200525