Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F22%3A00568618" target="_blank" >RIV/60077344:_____/22:00568618 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61389030:_____/22:00568618 RIV/60076658:12310/22:43904991

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867422007978?via%3Dihub#kwrds0010" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867422007978?via%3Dihub#kwrds0010</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2022.06.045" target="_blank" >10.1016/j.cell.2022.06.045</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The centromere represents a single region in most eukaryotic chromosomes. However, several plant and animal lineages assemble holocentromeres along the entire chromosome length. Here, we compare genome organization and evolution as a function of centromere type by assembling chromosome-scale hol-ocentric genomes with repeat-based holocentromeres from three beak-sedge (Rhynchospora pubera, R. breviuscula, and R. tenuis) and their closest monocentric relative, Juncus effusus. We demonstrate that transition to holocentricity affected 3D genome architecture by redefining genomic compartments, while distributing centromere function to thousands of repeat-based centromere units genome-wide. We uncover a complex genome organization in R. pubera that hides its unexpected octoploidy and describe a marked reduction in chromosome number for R. tenuis, which has only two chromosomes. We show that chromo-some fusions, facilitated by repeat-based holocentromeres, promoted karyotype evolution and diploidiza-tion. Our study thus sheds light on several important aspects of genome architecture and evolution influenced by centromere organization.

  • Název v anglickém jazyce

    Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution

  • Popis výsledku anglicky

    The centromere represents a single region in most eukaryotic chromosomes. However, several plant and animal lineages assemble holocentromeres along the entire chromosome length. Here, we compare genome organization and evolution as a function of centromere type by assembling chromosome-scale hol-ocentric genomes with repeat-based holocentromeres from three beak-sedge (Rhynchospora pubera, R. breviuscula, and R. tenuis) and their closest monocentric relative, Juncus effusus. We demonstrate that transition to holocentricity affected 3D genome architecture by redefining genomic compartments, while distributing centromere function to thousands of repeat-based centromere units genome-wide. We uncover a complex genome organization in R. pubera that hides its unexpected octoploidy and describe a marked reduction in chromosome number for R. tenuis, which has only two chromosomes. We show that chromo-some fusions, facilitated by repeat-based holocentromeres, promoted karyotype evolution and diploidiza-tion. Our study thus sheds light on several important aspects of genome architecture and evolution influenced by centromere organization.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Cell

  • ISSN

    0092-8674

  • e-ISSN

    1097-4172

  • Svazek periodika

    185

  • Číslo periodika v rámci svazku

    17

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    16

  • Strana od-do

    3153-3168

  • Kód UT WoS článku

    000877930800003

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85135412549