Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

The role of repetitive sequences in repatterning of major ribosomal DNA clusters in Lepidoptera

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F23%3A00572837" target="_blank" >RIV/60077344:_____/23:00572837 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60076658:12310/23:43906472

  • Výsledek na webu

    <a href="https://academic.oup.com/gbe/article-pdf/15/6/evad090/50569543/evad090.pdf" target="_blank" >https://academic.oup.com/gbe/article-pdf/15/6/evad090/50569543/evad090.pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evad090" target="_blank" >10.1093/gbe/evad090</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    The role of repetitive sequences in repatterning of major ribosomal DNA clusters in Lepidoptera

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Genes for major ribosomal RNAs (rDNA) are present in multiple copies mainly organized in tandem arrays. The number and position of rDNA loci can change dynamically and their repatterning is presumably driven by other repetitive sequences. We explored a peculiar rDNA organization in several representatives of Lepidoptera with either extremely large or numerous rDNA clusters. We combined molecular cytogenetics with analyses of second- and third-generation sequencing data to show that rDNA spreads as a transcription unit and reveal association between rDNA and various repeats. Furthermore, we performed comparative long read analyses among the species with derived rDNA distribution and moths with a single rDNA locus, which is considered ancestral. Our results suggest that satellite arrays, rather than mobile elements, facilitate homology-mediated spread of rDNA via either integration of extrachromosomal rDNA circles or ectopic recombination. The latter arguably better explains preferential spread of rDNA into terminal regions of lepidopteran chromosomes as efficiency of ectopic recombination depends on the proximity of homologous sequences to telomeres.

  • Název v anglickém jazyce

    The role of repetitive sequences in repatterning of major ribosomal DNA clusters in Lepidoptera

  • Popis výsledku anglicky

    Genes for major ribosomal RNAs (rDNA) are present in multiple copies mainly organized in tandem arrays. The number and position of rDNA loci can change dynamically and their repatterning is presumably driven by other repetitive sequences. We explored a peculiar rDNA organization in several representatives of Lepidoptera with either extremely large or numerous rDNA clusters. We combined molecular cytogenetics with analyses of second- and third-generation sequencing data to show that rDNA spreads as a transcription unit and reveal association between rDNA and various repeats. Furthermore, we performed comparative long read analyses among the species with derived rDNA distribution and moths with a single rDNA locus, which is considered ancestral. Our results suggest that satellite arrays, rather than mobile elements, facilitate homology-mediated spread of rDNA via either integration of extrachromosomal rDNA circles or ectopic recombination. The latter arguably better explains preferential spread of rDNA into terminal regions of lepidopteran chromosomes as efficiency of ectopic recombination depends on the proximity of homologous sequences to telomeres.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Genome Biology and Evolution

  • ISSN

    1759-6653

  • e-ISSN

    1759-6653

  • Svazek periodika

    15

  • Číslo periodika v rámci svazku

    6

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    17

  • Strana od-do

    evad090

  • Kód UT WoS článku

    001004108900001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85162992285