Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis: experimental approach and procedures.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077379%3A_____%2F02%3A61033052" target="_blank" >RIV/60077379:_____/02:61033052 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis: experimental approach and procedures.

Popis výsledku v původním jazyce

We adapted the amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) to examine the bacterial communities associated with the soil dwelling larvae of Penthetria holosericea (Diptera) and with vermicompost and earthworm (Eisenia andrei) gut content. Following DNA isolation and PCR amplification of the 16S rDNA, three restriction enzymes were used to generate ARDRA patterns. Resulting fragments were separated in a 1,5% agarose gel. When the universal eubacterial primers 63f and 1387r were used, the ARDRA patterns proved to be complex and difficult to resolve, although some minor differences were noted. The use of taxon specific PCR primers resulted in less complicated patterns and more differences in the band composition. The method is fast, cheap and useful in the characterization of bacterial communities.

Název v anglickém jazyce

Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis: experimental approach and procedures.

Popis výsledku anglicky

We adapted the amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) to examine the bacterial communities associated with the soil dwelling larvae of Penthetria holosericea (Diptera) and with vermicompost and earthworm (Eisenia andrei) gut content. Following DNA isolation and PCR amplification of the 16S rDNA, three restriction enzymes were used to generate ARDRA patterns. Resulting fragments were separated in a 1,5% agarose gel. When the universal eubacterial primers 63f and 1387r were used, the ARDRA patterns proved to be complex and difficult to resolve, although some minor differences were noted. The use of taxon specific PCR primers resulted in less complicated patterns and more differences in the band composition. The method is fast, cheap and useful in the characterization of bacterial communities.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EH - Ekologie – společenstva

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2002

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Život v pode. 3. medzinárodný seminár, sborník příspěvků na CD.

ISBN

—

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

5-7

Název nakladatele

Československá spoločnosť mikrobiologická

Místo vydání

Bratislava

Místo konání akce

Bratislava [SK]

Datum konání akce

29. 1. 2002

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—