La protein Trypanosoma brucei je kandidátní poly(U) chránící protein, který ovlivňuje zrání spliced leader RNA a odstranění intronu z tRNA
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077409%3A_____%2F05%3A00023737" target="_blank" >RIV/60077409:_____/05:00023737 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60076658:12310/05:00008718
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
The Trypanosoma brucei La protein is a candidate poly(U) shield that impacts spliced leader RNA maturation and tRNA intron removal
Popis výsledku v původním jazyce
By virtue of its preferential binding to poly(U) tails on small RNA precursors and nuclear localisation motif, the La protein has been implicated for a role in the stabilisation and nuclear retention of processing intermediates for a variety of small RNAs in eukaryotic cells. La protein was targeted for selective knockdown by inducible RNA interference in Trypanosoma brucei. In the relative absence of La protein T. brucei cells were not viable, in contrast to La gene knockouts in yeast. A variety of potential small RNA substrates were examined under induction, including spliced leader RNA, spliced leader associated RNA, the U1, U2, U4, and U6 small nuclear RNAs, 5S ribosomal RNA, U3 small nucleolar RNA, and tRNATyr. This study indicates that La proteinbinding is not essential for maturation of the spliced leader RNA, but does not rule out the presence of an alternative processing pathway that could compensate for the absence of normally-associated La protein.
Název v anglickém jazyce
The Trypanosoma brucei La protein is a candidate poly(U) shield that impacts spliced leader RNA maturation and tRNA intron removal
Popis výsledku anglicky
By virtue of its preferential binding to poly(U) tails on small RNA precursors and nuclear localisation motif, the La protein has been implicated for a role in the stabilisation and nuclear retention of processing intermediates for a variety of small RNAs in eukaryotic cells. La protein was targeted for selective knockdown by inducible RNA interference in Trypanosoma brucei. In the relative absence of La protein T. brucei cells were not viable, in contrast to La gene knockouts in yeast. A variety of potential small RNA substrates were examined under induction, including spliced leader RNA, spliced leader associated RNA, the U1, U2, U4, and U6 small nuclear RNAs, 5S ribosomal RNA, U3 small nucleolar RNA, and tRNATyr. This study indicates that La proteinbinding is not essential for maturation of the spliced leader RNA, but does not rule out the presence of an alternative processing pathway that could compensate for the absence of normally-associated La protein.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/IAA5022302" target="_blank" >IAA5022302: Funkční analýza vybraných proteinů účastnících se editování RNA u bičíkovce Trypanosoma brucei</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2005
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
International Journal for Parasitology
ISSN
0020-7519
e-ISSN
—
Svazek periodika
35
Číslo periodika v rámci svazku
4
Stát vydavatele periodika
AU - Austrálie
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
359-366
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—